Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP99

TREM1, Triggering receptor expressed on myeloid cells 1, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREM1Q9NP99 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TREM1Q9NP99 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TREM1Q9NP99 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TREM1Q9NP99 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TREM1Q9NP99 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TREM1Q9NP99 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TREM1Q9NP99 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TREM1Q9NP99 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TREM1Q9NP99 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TREM1Q9NP99 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TREM1Q9NP99 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TREM1Q9NP99 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TREM1Q9NP99 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TREM1Q9NP99 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TREM1Q9NP99 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TREM1Q9NP99 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TREM1Q9NP99 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TREM1Q9NP99 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TREM1Q9NP99 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TREM1Q9NP99 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TREM1Q9NP99 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TREM1Q9NP99 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TREM1Q9NP99 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TREM1Q9NP99 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TREM1Q9NP99 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TREM1Q9NP99 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TREM1Q9NP99 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TREM1Q9NP99 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TREM1Q9NP99 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TREM1Q9NP99 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TREM1Q9NP99 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TREM1Q9NP99 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TREM1Q9NP99 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TREM1Q9NP99 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TREM1Q9NP99 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TREM1Q9NP99 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TREM1Q9NP99 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TREM1Q9NP99 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TREM1Q9NP99 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TREM1Q9NP99 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TREM1Q9NP99 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TREM1Q9NP99 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TREM1Q9NP99 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TREM1Q9NP99 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TREM1Q9NP99 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TREM1Q9NP99 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TREM1Q9NP99 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TREM1Q9NP99 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TREM1Q9NP99 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TREM1Q9NP99 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TREM1Q9NP99 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TREM1Q9NP99 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TREM1Q9NP99 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TREM1Q9NP99 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TREM1Q9NP99 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TREM1Q9NP99 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TREM1Q9NP99 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TREM1Q9NP99 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TREM1Q9NP99 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TREM1Q9NP99 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TREM1Q9NP99 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TREM1Q9NP99 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TREM1Q9NP99 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TREM1Q9NP99 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TREM1Q9NP99 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TREM1Q9NP99 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TREM1Q9NP99 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TREM1Q9NP99 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TREM1Q9NP99 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TREM1Q9NP99 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TREM1Q9NP99 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TREM1Q9NP99 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TREM1Q9NP99 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TREM1Q9NP99 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TREM1Q9NP99 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TREM1Q9NP99 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TREM1Q9NP99 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TREM1Q9NP99 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TREM1Q9NP99 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TREM1Q9NP99 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TREM1Q9NP99 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TREM1Q9NP99 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TREM1Q9NP99 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TREM1Q9NP99 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TREM1Q9NP99 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TREM1Q9NP99 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TREM1Q9NP99 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TREM1Q9NP99 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TREM1Q9NP99 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TREM1Q9NP99 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TREM1Q9NP99 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TREM1Q9NP99 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TREM1Q9NP99 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TREM1Q9NP99 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TREM1Q9NP99 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TREM1Q9NP99 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TREM1Q9NP99 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TREM1Q9NP99 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TREM1Q9NP99 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TREM1Q9NP99 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms