Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCE7

SMURF1, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF1, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMURF1Q9HCE7 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SMURF1Q9HCE7 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SMURF1Q9HCE7 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SMURF1Q9HCE7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMURF1Q9HCE7 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMURF1Q9HCE7 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMURF1Q9HCE7 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMURF1Q9HCE7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMURF1Q9HCE7 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMURF1Q9HCE7 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMURF1Q9HCE7 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMURF1Q9HCE7 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMURF1Q9HCE7 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMURF1Q9HCE7 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMURF1Q9HCE7 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMURF1Q9HCE7 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMURF1Q9HCE7 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMURF1Q9HCE7 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMURF1Q9HCE7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMURF1Q9HCE7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMURF1Q9HCE7 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMURF1Q9HCE7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMURF1Q9HCE7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SMURF1Q9HCE7 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMURF1Q9HCE7 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMURF1Q9HCE7 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMURF1Q9HCE7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMURF1Q9HCE7 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMURF1Q9HCE7 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMURF1Q9HCE7 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMURF1Q9HCE7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMURF1Q9HCE7 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMURF1Q9HCE7 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMURF1Q9HCE7 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMURF1Q9HCE7 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMURF1Q9HCE7 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMURF1Q9HCE7 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMURF1Q9HCE7 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMURF1Q9HCE7 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMURF1Q9HCE7 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMURF1Q9HCE7 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMURF1Q9HCE7 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMURF1Q9HCE7 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMURF1Q9HCE7 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMURF1Q9HCE7 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMURF1Q9HCE7 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMURF1Q9HCE7 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMURF1Q9HCE7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMURF1Q9HCE7 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMURF1Q9HCE7 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMURF1Q9HCE7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMURF1Q9HCE7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMURF1Q9HCE7 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMURF1Q9HCE7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMURF1Q9HCE7 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMURF1Q9HCE7 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMURF1Q9HCE7 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMURF1Q9HCE7 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMURF1Q9HCE7 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMURF1Q9HCE7 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMURF1Q9HCE7 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMURF1Q9HCE7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMURF1Q9HCE7 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMURF1Q9HCE7 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMURF1Q9HCE7 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMURF1Q9HCE7 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMURF1Q9HCE7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMURF1Q9HCE7 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMURF1Q9HCE7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SMURF1Q9HCE7 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMURF1Q9HCE7 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMURF1Q9HCE7 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMURF1Q9HCE7 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMURF1Q9HCE7 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMURF1Q9HCE7 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMURF1Q9HCE7 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMURF1Q9HCE7 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMURF1Q9HCE7 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SMURF1Q9HCE7 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SMURF1Q9HCE7 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMURF1Q9HCE7 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMURF1Q9HCE7 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMURF1Q9HCE7 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMURF1Q9HCE7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMURF1Q9HCE7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMURF1Q9HCE7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMURF1Q9HCE7 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SMURF1Q9HCE7 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMURF1Q9HCE7 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMURF1Q9HCE7 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMURF1Q9HCE7 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMURF1Q9HCE7 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMURF1Q9HCE7 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMURF1Q9HCE7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMURF1Q9HCE7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMURF1Q9HCE7 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMURF1Q9HCE7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMURF1Q9HCE7 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMURF1Q9HCE7 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMURF1Q9HCE7 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms