Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Q2

COPS7B, COP9 signalosome complex subunit 7b, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7BQ9H9Q2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COPS7BQ9H9Q2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COPS7BQ9H9Q2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COPS7BQ9H9Q2 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COPS7BQ9H9Q2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COPS7BQ9H9Q2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
COPS7BQ9H9Q2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COPS7BQ9H9Q2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
COPS7BQ9H9Q2 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COPS7BQ9H9Q2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COPS7BQ9H9Q2 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COPS7BQ9H9Q2 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COPS7BQ9H9Q2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COPS7BQ9H9Q2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COPS7BQ9H9Q2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
COPS7BQ9H9Q2 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COPS7BQ9H9Q2 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COPS7BQ9H9Q2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COPS7BQ9H9Q2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COPS7BQ9H9Q2 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COPS7BQ9H9Q2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COPS7BQ9H9Q2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COPS7BQ9H9Q2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COPS7BQ9H9Q2 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COPS7BQ9H9Q2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COPS7BQ9H9Q2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COPS7BQ9H9Q2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COPS7BQ9H9Q2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COPS7BQ9H9Q2 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COPS7BQ9H9Q2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COPS7BQ9H9Q2 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COPS7BQ9H9Q2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COPS7BQ9H9Q2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COPS7BQ9H9Q2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COPS7BQ9H9Q2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COPS7BQ9H9Q2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COPS7BQ9H9Q2 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COPS7BQ9H9Q2 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COPS7BQ9H9Q2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COPS7BQ9H9Q2 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COPS7BQ9H9Q2 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COPS7BQ9H9Q2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COPS7BQ9H9Q2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COPS7BQ9H9Q2 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COPS7BQ9H9Q2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COPS7BQ9H9Q2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COPS7BQ9H9Q2 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
COPS7BQ9H9Q2 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COPS7BQ9H9Q2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
COPS7BQ9H9Q2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
COPS7BQ9H9Q2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
COPS7BQ9H9Q2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COPS7BQ9H9Q2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
COPS7BQ9H9Q2 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
COPS7BQ9H9Q2 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COPS7BQ9H9Q2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COPS7BQ9H9Q2 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COPS7BQ9H9Q2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
COPS7BQ9H9Q2 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COPS7BQ9H9Q2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
COPS7BQ9H9Q2 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COPS7BQ9H9Q2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COPS7BQ9H9Q2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COPS7BQ9H9Q2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
COPS7BQ9H9Q2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
COPS7BQ9H9Q2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COPS7BQ9H9Q2 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
COPS7BQ9H9Q2 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COPS7BQ9H9Q2 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
COPS7BQ9H9Q2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
COPS7BQ9H9Q2 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
COPS7BQ9H9Q2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
COPS7BQ9H9Q2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
COPS7BQ9H9Q2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
COPS7BQ9H9Q2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
COPS7BQ9H9Q2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
COPS7BQ9H9Q2 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
COPS7BQ9H9Q2 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
COPS7BQ9H9Q2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
COPS7BQ9H9Q2 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
COPS7BQ9H9Q2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
COPS7BQ9H9Q2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
COPS7BQ9H9Q2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
COPS7BQ9H9Q2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
COPS7BQ9H9Q2 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
COPS7BQ9H9Q2 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COPS7BQ9H9Q2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COPS7BQ9H9Q2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COPS7BQ9H9Q2 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COPS7BQ9H9Q2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COPS7BQ9H9Q2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COPS7BQ9H9Q2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COPS7BQ9H9Q2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COPS7BQ9H9Q2 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COPS7BQ9H9Q2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COPS7BQ9H9Q2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COPS7BQ9H9Q2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COPS7BQ9H9Q2 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COPS7BQ9H9Q2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COPS7BQ9H9Q2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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