Protein–RNA interactions for Protein: Q9H611

PIF1, ATP-dependent DNA helicase PIF1, humanhuman

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIF1Q9H611 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PIF1Q9H611 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PIF1Q9H611 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PIF1Q9H611 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PIF1Q9H611 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PIF1Q9H611 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PIF1Q9H611 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PIF1Q9H611 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PIF1Q9H611 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PIF1Q9H611 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PIF1Q9H611 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PIF1Q9H611 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PIF1Q9H611 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PIF1Q9H611 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PIF1Q9H611 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PIF1Q9H611 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PIF1Q9H611 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PIF1Q9H611 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PIF1Q9H611 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
PIF1Q9H611 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PIF1Q9H611 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PIF1Q9H611 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PIF1Q9H611 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PIF1Q9H611 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PIF1Q9H611 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PIF1Q9H611 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PIF1Q9H611 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PIF1Q9H611 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PIF1Q9H611 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PIF1Q9H611 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PIF1Q9H611 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PIF1Q9H611 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PIF1Q9H611 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PIF1Q9H611 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PIF1Q9H611 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PIF1Q9H611 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PIF1Q9H611 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PIF1Q9H611 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PIF1Q9H611 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PIF1Q9H611 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PIF1Q9H611 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PIF1Q9H611 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PIF1Q9H611 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PIF1Q9H611 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PIF1Q9H611 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PIF1Q9H611 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PIF1Q9H611 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIF1Q9H611 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIF1Q9H611 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIF1Q9H611 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIF1Q9H611 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PIF1Q9H611 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIF1Q9H611 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIF1Q9H611 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIF1Q9H611 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIF1Q9H611 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIF1Q9H611 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PIF1Q9H611 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PIF1Q9H611 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PIF1Q9H611 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PIF1Q9H611 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PIF1Q9H611 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PIF1Q9H611 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PIF1Q9H611 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PIF1Q9H611 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PIF1Q9H611 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PIF1Q9H611 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PIF1Q9H611 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PIF1Q9H611 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PIF1Q9H611 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PIF1Q9H611 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PIF1Q9H611 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PIF1Q9H611 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PIF1Q9H611 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PIF1Q9H611 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PIF1Q9H611 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PIF1Q9H611 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PIF1Q9H611 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PIF1Q9H611 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PIF1Q9H611 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PIF1Q9H611 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PIF1Q9H611 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PIF1Q9H611 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PIF1Q9H611 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PIF1Q9H611 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PIF1Q9H611 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PIF1Q9H611 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PIF1Q9H611 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PIF1Q9H611 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PIF1Q9H611 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PIF1Q9H611 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PIF1Q9H611 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
PIF1Q9H611 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PIF1Q9H611 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PIF1Q9H611 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PIF1Q9H611 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PIF1Q9H611 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PIF1Q9H611 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PIF1Q9H611 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PIF1Q9H611 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms