Protein–RNA interactions for Protein: Q9H089

LSG1, Large subunit GTPase 1 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSG1Q9H089 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LSG1Q9H089 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LSG1Q9H089 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
LSG1Q9H089 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
LSG1Q9H089 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LSG1Q9H089 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LSG1Q9H089 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LSG1Q9H089 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LSG1Q9H089 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LSG1Q9H089 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LSG1Q9H089 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LSG1Q9H089 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LSG1Q9H089 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LSG1Q9H089 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LSG1Q9H089 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LSG1Q9H089 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LSG1Q9H089 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LSG1Q9H089 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LSG1Q9H089 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LSG1Q9H089 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LSG1Q9H089 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LSG1Q9H089 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LSG1Q9H089 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LSG1Q9H089 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LSG1Q9H089 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LSG1Q9H089 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LSG1Q9H089 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LSG1Q9H089 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LSG1Q9H089 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LSG1Q9H089 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
LSG1Q9H089 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LSG1Q9H089 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LSG1Q9H089 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LSG1Q9H089 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LSG1Q9H089 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LSG1Q9H089 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LSG1Q9H089 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
LSG1Q9H089 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LSG1Q9H089 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LSG1Q9H089 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LSG1Q9H089 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LSG1Q9H089 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LSG1Q9H089 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LSG1Q9H089 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LSG1Q9H089 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LSG1Q9H089 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LSG1Q9H089 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
LSG1Q9H089 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LSG1Q9H089 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LSG1Q9H089 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LSG1Q9H089 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LSG1Q9H089 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LSG1Q9H089 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LSG1Q9H089 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
LSG1Q9H089 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LSG1Q9H089 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LSG1Q9H089 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LSG1Q9H089 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LSG1Q9H089 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LSG1Q9H089 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LSG1Q9H089 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LSG1Q9H089 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LSG1Q9H089 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LSG1Q9H089 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LSG1Q9H089 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
LSG1Q9H089 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LSG1Q9H089 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LSG1Q9H089 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LSG1Q9H089 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LSG1Q9H089 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
LSG1Q9H089 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LSG1Q9H089 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LSG1Q9H089 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LSG1Q9H089 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LSG1Q9H089 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LSG1Q9H089 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LSG1Q9H089 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LSG1Q9H089 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LSG1Q9H089 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LSG1Q9H089 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LSG1Q9H089 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LSG1Q9H089 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LSG1Q9H089 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LSG1Q9H089 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LSG1Q9H089 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LSG1Q9H089 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LSG1Q9H089 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LSG1Q9H089 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LSG1Q9H089 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LSG1Q9H089 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LSG1Q9H089 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LSG1Q9H089 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LSG1Q9H089 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LSG1Q9H089 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LSG1Q9H089 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LSG1Q9H089 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LSG1Q9H089 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
LSG1Q9H089 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LSG1Q9H089 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LSG1Q9H089 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms