Protein–RNA interactions for Protein: Q9H015

SLC22A4, Solute carrier family 22 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A4Q9H015 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC22A4Q9H015 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC22A4Q9H015 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC22A4Q9H015 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC22A4Q9H015 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC22A4Q9H015 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC22A4Q9H015 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC22A4Q9H015 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC22A4Q9H015 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC22A4Q9H015 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC22A4Q9H015 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SLC22A4Q9H015 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SLC22A4Q9H015 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SLC22A4Q9H015 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC22A4Q9H015 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC22A4Q9H015 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC22A4Q9H015 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC22A4Q9H015 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC22A4Q9H015 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC22A4Q9H015 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC22A4Q9H015 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC22A4Q9H015 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC22A4Q9H015 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC22A4Q9H015 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC22A4Q9H015 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC22A4Q9H015 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC22A4Q9H015 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC22A4Q9H015 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC22A4Q9H015 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC22A4Q9H015 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC22A4Q9H015 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC22A4Q9H015 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC22A4Q9H015 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC22A4Q9H015 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC22A4Q9H015 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC22A4Q9H015 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC22A4Q9H015 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC22A4Q9H015 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC22A4Q9H015 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC22A4Q9H015 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC22A4Q9H015 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC22A4Q9H015 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC22A4Q9H015 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC22A4Q9H015 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC22A4Q9H015 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC22A4Q9H015 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC22A4Q9H015 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC22A4Q9H015 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC22A4Q9H015 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC22A4Q9H015 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC22A4Q9H015 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC22A4Q9H015 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC22A4Q9H015 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC22A4Q9H015 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC22A4Q9H015 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC22A4Q9H015 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC22A4Q9H015 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC22A4Q9H015 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC22A4Q9H015 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC22A4Q9H015 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC22A4Q9H015 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC22A4Q9H015 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC22A4Q9H015 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC22A4Q9H015 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC22A4Q9H015 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC22A4Q9H015 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC22A4Q9H015 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC22A4Q9H015 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC22A4Q9H015 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC22A4Q9H015 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC22A4Q9H015 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC22A4Q9H015 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC22A4Q9H015 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC22A4Q9H015 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC22A4Q9H015 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC22A4Q9H015 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC22A4Q9H015 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC22A4Q9H015 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC22A4Q9H015 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC22A4Q9H015 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC22A4Q9H015 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC22A4Q9H015 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC22A4Q9H015 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC22A4Q9H015 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC22A4Q9H015 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC22A4Q9H015 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC22A4Q9H015 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC22A4Q9H015 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC22A4Q9H015 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC22A4Q9H015 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC22A4Q9H015 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC22A4Q9H015 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC22A4Q9H015 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC22A4Q9H015 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC22A4Q9H015 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC22A4Q9H015 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC22A4Q9H015 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC22A4Q9H015 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC22A4Q9H015 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC22A4Q9H015 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms