Protein–RNA interactions for Protein: Q9H000

MKRN2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN2Q9H000 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MKRN2Q9H000 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MKRN2Q9H000 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MKRN2Q9H000 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MKRN2Q9H000 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MKRN2Q9H000 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MKRN2Q9H000 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MKRN2Q9H000 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MKRN2Q9H000 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MKRN2Q9H000 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MKRN2Q9H000 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MKRN2Q9H000 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MKRN2Q9H000 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MKRN2Q9H000 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MKRN2Q9H000 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MKRN2Q9H000 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MKRN2Q9H000 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MKRN2Q9H000 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MKRN2Q9H000 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MKRN2Q9H000 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MKRN2Q9H000 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MKRN2Q9H000 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MKRN2Q9H000 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MKRN2Q9H000 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MKRN2Q9H000 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MKRN2Q9H000 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MKRN2Q9H000 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MKRN2Q9H000 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MKRN2Q9H000 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MKRN2Q9H000 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MKRN2Q9H000 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MKRN2Q9H000 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MKRN2Q9H000 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MKRN2Q9H000 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MKRN2Q9H000 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MKRN2Q9H000 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MKRN2Q9H000 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MKRN2Q9H000 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
MKRN2Q9H000 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MKRN2Q9H000 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MKRN2Q9H000 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MKRN2Q9H000 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
MKRN2Q9H000 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MKRN2Q9H000 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MKRN2Q9H000 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MKRN2Q9H000 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MKRN2Q9H000 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MKRN2Q9H000 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MKRN2Q9H000 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MKRN2Q9H000 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MKRN2Q9H000 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MKRN2Q9H000 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MKRN2Q9H000 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MKRN2Q9H000 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MKRN2Q9H000 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MKRN2Q9H000 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MKRN2Q9H000 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MKRN2Q9H000 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MKRN2Q9H000 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MKRN2Q9H000 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MKRN2Q9H000 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MKRN2Q9H000 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MKRN2Q9H000 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MKRN2Q9H000 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MKRN2Q9H000 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MKRN2Q9H000 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MKRN2Q9H000 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MKRN2Q9H000 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MKRN2Q9H000 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MKRN2Q9H000 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MKRN2Q9H000 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MKRN2Q9H000 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MKRN2Q9H000 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MKRN2Q9H000 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MKRN2Q9H000 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
MKRN2Q9H000 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
MKRN2Q9H000 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MKRN2Q9H000 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MKRN2Q9H000 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MKRN2Q9H000 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MKRN2Q9H000 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MKRN2Q9H000 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MKRN2Q9H000 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MKRN2Q9H000 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MKRN2Q9H000 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
MKRN2Q9H000 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
MKRN2Q9H000 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MKRN2Q9H000 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MKRN2Q9H000 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
MKRN2Q9H000 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MKRN2Q9H000 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MKRN2Q9H000 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MKRN2Q9H000 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MKRN2Q9H000 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MKRN2Q9H000 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MKRN2Q9H000 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MKRN2Q9H000 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
MKRN2Q9H000 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MKRN2Q9H000 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MKRN2Q9H000 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms