Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ6

CHRNA10, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-10, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA10Q9GZZ6 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHRNA10Q9GZZ6 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHRNA10Q9GZZ6 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHRNA10Q9GZZ6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHRNA10Q9GZZ6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHRNA10Q9GZZ6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHRNA10Q9GZZ6 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHRNA10Q9GZZ6 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHRNA10Q9GZZ6 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHRNA10Q9GZZ6 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHRNA10Q9GZZ6 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CHRNA10Q9GZZ6 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHRNA10Q9GZZ6 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHRNA10Q9GZZ6 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHRNA10Q9GZZ6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHRNA10Q9GZZ6 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHRNA10Q9GZZ6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CHRNA10Q9GZZ6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CHRNA10Q9GZZ6 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHRNA10Q9GZZ6 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHRNA10Q9GZZ6 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHRNA10Q9GZZ6 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHRNA10Q9GZZ6 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHRNA10Q9GZZ6 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHRNA10Q9GZZ6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHRNA10Q9GZZ6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHRNA10Q9GZZ6 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHRNA10Q9GZZ6 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHRNA10Q9GZZ6 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHRNA10Q9GZZ6 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CHRNA10Q9GZZ6 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHRNA10Q9GZZ6 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHRNA10Q9GZZ6 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CHRNA10Q9GZZ6 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CHRNA10Q9GZZ6 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHRNA10Q9GZZ6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHRNA10Q9GZZ6 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHRNA10Q9GZZ6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CHRNA10Q9GZZ6 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHRNA10Q9GZZ6 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHRNA10Q9GZZ6 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHRNA10Q9GZZ6 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHRNA10Q9GZZ6 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHRNA10Q9GZZ6 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CHRNA10Q9GZZ6 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHRNA10Q9GZZ6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHRNA10Q9GZZ6 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRNA10Q9GZZ6 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRNA10Q9GZZ6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRNA10Q9GZZ6 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRNA10Q9GZZ6 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRNA10Q9GZZ6 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRNA10Q9GZZ6 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRNA10Q9GZZ6 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRNA10Q9GZZ6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRNA10Q9GZZ6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRNA10Q9GZZ6 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRNA10Q9GZZ6 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRNA10Q9GZZ6 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRNA10Q9GZZ6 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRNA10Q9GZZ6 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRNA10Q9GZZ6 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRNA10Q9GZZ6 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRNA10Q9GZZ6 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRNA10Q9GZZ6 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRNA10Q9GZZ6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRNA10Q9GZZ6 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHRNA10Q9GZZ6 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CHRNA10Q9GZZ6 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHRNA10Q9GZZ6 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHRNA10Q9GZZ6 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHRNA10Q9GZZ6 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHRNA10Q9GZZ6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHRNA10Q9GZZ6 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CHRNA10Q9GZZ6 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHRNA10Q9GZZ6 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHRNA10Q9GZZ6 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CHRNA10Q9GZZ6 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHRNA10Q9GZZ6 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHRNA10Q9GZZ6 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHRNA10Q9GZZ6 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHRNA10Q9GZZ6 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHRNA10Q9GZZ6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHRNA10Q9GZZ6 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHRNA10Q9GZZ6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHRNA10Q9GZZ6 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHRNA10Q9GZZ6 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHRNA10Q9GZZ6 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHRNA10Q9GZZ6 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHRNA10Q9GZZ6 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CHRNA10Q9GZZ6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHRNA10Q9GZZ6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHRNA10Q9GZZ6 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNA10Q9GZZ6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNA10Q9GZZ6 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNA10Q9GZZ6 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNA10Q9GZZ6 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNA10Q9GZZ6 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNA10Q9GZZ6 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNA10Q9GZZ6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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