Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT3

SLIRP, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIRPQ9GZT3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLIRPQ9GZT3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLIRPQ9GZT3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLIRPQ9GZT3 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLIRPQ9GZT3 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLIRPQ9GZT3 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLIRPQ9GZT3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SLIRPQ9GZT3 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLIRPQ9GZT3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLIRPQ9GZT3 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLIRPQ9GZT3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SLIRPQ9GZT3 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLIRPQ9GZT3 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLIRPQ9GZT3 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLIRPQ9GZT3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLIRPQ9GZT3 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLIRPQ9GZT3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLIRPQ9GZT3 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLIRPQ9GZT3 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLIRPQ9GZT3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLIRPQ9GZT3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLIRPQ9GZT3 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLIRPQ9GZT3 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLIRPQ9GZT3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLIRPQ9GZT3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLIRPQ9GZT3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLIRPQ9GZT3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLIRPQ9GZT3 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLIRPQ9GZT3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLIRPQ9GZT3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLIRPQ9GZT3 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLIRPQ9GZT3 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLIRPQ9GZT3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLIRPQ9GZT3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLIRPQ9GZT3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLIRPQ9GZT3 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLIRPQ9GZT3 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLIRPQ9GZT3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLIRPQ9GZT3 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLIRPQ9GZT3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLIRPQ9GZT3 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLIRPQ9GZT3 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLIRPQ9GZT3 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLIRPQ9GZT3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLIRPQ9GZT3 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLIRPQ9GZT3 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLIRPQ9GZT3 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLIRPQ9GZT3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLIRPQ9GZT3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLIRPQ9GZT3 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLIRPQ9GZT3 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLIRPQ9GZT3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLIRPQ9GZT3 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLIRPQ9GZT3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLIRPQ9GZT3 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLIRPQ9GZT3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLIRPQ9GZT3 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLIRPQ9GZT3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLIRPQ9GZT3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLIRPQ9GZT3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLIRPQ9GZT3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SLIRPQ9GZT3 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLIRPQ9GZT3 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLIRPQ9GZT3 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLIRPQ9GZT3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLIRPQ9GZT3 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLIRPQ9GZT3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLIRPQ9GZT3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLIRPQ9GZT3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLIRPQ9GZT3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLIRPQ9GZT3 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLIRPQ9GZT3 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLIRPQ9GZT3 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLIRPQ9GZT3 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLIRPQ9GZT3 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLIRPQ9GZT3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLIRPQ9GZT3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLIRPQ9GZT3 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLIRPQ9GZT3 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLIRPQ9GZT3 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLIRPQ9GZT3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLIRPQ9GZT3 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLIRPQ9GZT3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLIRPQ9GZT3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SLIRPQ9GZT3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLIRPQ9GZT3 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLIRPQ9GZT3 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SLIRPQ9GZT3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLIRPQ9GZT3 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLIRPQ9GZT3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLIRPQ9GZT3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLIRPQ9GZT3 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLIRPQ9GZT3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLIRPQ9GZT3 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLIRPQ9GZT3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLIRPQ9GZT3 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLIRPQ9GZT3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLIRPQ9GZT3 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLIRPQ9GZT3 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SLIRPQ9GZT3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms