Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZN8

C20orf27, UPF0687 protein C20orf27, humanhuman

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Length 174 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C20orf27Q9GZN8 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C20orf27Q9GZN8 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C20orf27Q9GZN8 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C20orf27Q9GZN8 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C20orf27Q9GZN8 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C20orf27Q9GZN8 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C20orf27Q9GZN8 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C20orf27Q9GZN8 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C20orf27Q9GZN8 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C20orf27Q9GZN8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C20orf27Q9GZN8 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C20orf27Q9GZN8 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C20orf27Q9GZN8 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C20orf27Q9GZN8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C20orf27Q9GZN8 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C20orf27Q9GZN8 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C20orf27Q9GZN8 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C20orf27Q9GZN8 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C20orf27Q9GZN8 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C20orf27Q9GZN8 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C20orf27Q9GZN8 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
C20orf27Q9GZN8 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C20orf27Q9GZN8 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C20orf27Q9GZN8 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C20orf27Q9GZN8 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C20orf27Q9GZN8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C20orf27Q9GZN8 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C20orf27Q9GZN8 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C20orf27Q9GZN8 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C20orf27Q9GZN8 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C20orf27Q9GZN8 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C20orf27Q9GZN8 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C20orf27Q9GZN8 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C20orf27Q9GZN8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C20orf27Q9GZN8 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C20orf27Q9GZN8 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C20orf27Q9GZN8 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C20orf27Q9GZN8 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C20orf27Q9GZN8 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C20orf27Q9GZN8 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C20orf27Q9GZN8 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C20orf27Q9GZN8 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C20orf27Q9GZN8 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C20orf27Q9GZN8 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C20orf27Q9GZN8 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C20orf27Q9GZN8 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C20orf27Q9GZN8 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C20orf27Q9GZN8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C20orf27Q9GZN8 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C20orf27Q9GZN8 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C20orf27Q9GZN8 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C20orf27Q9GZN8 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C20orf27Q9GZN8 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C20orf27Q9GZN8 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C20orf27Q9GZN8 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C20orf27Q9GZN8 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C20orf27Q9GZN8 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C20orf27Q9GZN8 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C20orf27Q9GZN8 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C20orf27Q9GZN8 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
C20orf27Q9GZN8 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
C20orf27Q9GZN8 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
C20orf27Q9GZN8 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
C20orf27Q9GZN8 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
C20orf27Q9GZN8 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
C20orf27Q9GZN8 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C20orf27Q9GZN8 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C20orf27Q9GZN8 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C20orf27Q9GZN8 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C20orf27Q9GZN8 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C20orf27Q9GZN8 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C20orf27Q9GZN8 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C20orf27Q9GZN8 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C20orf27Q9GZN8 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C20orf27Q9GZN8 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C20orf27Q9GZN8 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C20orf27Q9GZN8 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C20orf27Q9GZN8 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C20orf27Q9GZN8 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C20orf27Q9GZN8 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C20orf27Q9GZN8 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C20orf27Q9GZN8 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C20orf27Q9GZN8 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C20orf27Q9GZN8 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
C20orf27Q9GZN8 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C20orf27Q9GZN8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C20orf27Q9GZN8 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C20orf27Q9GZN8 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
C20orf27Q9GZN8 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
C20orf27Q9GZN8 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C20orf27Q9GZN8 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
C20orf27Q9GZN8 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C20orf27Q9GZN8 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C20orf27Q9GZN8 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C20orf27Q9GZN8 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C20orf27Q9GZN8 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C20orf27Q9GZN8 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C20orf27Q9GZN8 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C20orf27Q9GZN8 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C20orf27Q9GZN8 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
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