Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BHLHE41Q9C0J9 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BHLHE41Q9C0J9 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BHLHE41Q9C0J9 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BHLHE41Q9C0J9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BHLHE41Q9C0J9 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BHLHE41Q9C0J9 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BHLHE41Q9C0J9 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BHLHE41Q9C0J9 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BHLHE41Q9C0J9 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BHLHE41Q9C0J9 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BHLHE41Q9C0J9 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BHLHE41Q9C0J9 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BHLHE41Q9C0J9 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BHLHE41Q9C0J9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BHLHE41Q9C0J9 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
BHLHE41Q9C0J9 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BHLHE41Q9C0J9 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BHLHE41Q9C0J9 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BHLHE41Q9C0J9 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BHLHE41Q9C0J9 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BHLHE41Q9C0J9 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BHLHE41Q9C0J9 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BHLHE41Q9C0J9 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BHLHE41Q9C0J9 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BHLHE41Q9C0J9 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BHLHE41Q9C0J9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BHLHE41Q9C0J9 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BHLHE41Q9C0J9 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BHLHE41Q9C0J9 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
BHLHE41Q9C0J9 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BHLHE41Q9C0J9 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BHLHE41Q9C0J9 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BHLHE41Q9C0J9 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BHLHE41Q9C0J9 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BHLHE41Q9C0J9 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BHLHE41Q9C0J9 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BHLHE41Q9C0J9 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BHLHE41Q9C0J9 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BHLHE41Q9C0J9 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BHLHE41Q9C0J9 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BHLHE41Q9C0J9 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BHLHE41Q9C0J9 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BHLHE41Q9C0J9 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BHLHE41Q9C0J9 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BHLHE41Q9C0J9 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
BHLHE41Q9C0J9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BHLHE41Q9C0J9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BHLHE41Q9C0J9 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BHLHE41Q9C0J9 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
BHLHE41Q9C0J9 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
BHLHE41Q9C0J9 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
BHLHE41Q9C0J9 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
BHLHE41Q9C0J9 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
BHLHE41Q9C0J9 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
BHLHE41Q9C0J9 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BHLHE41Q9C0J9 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BHLHE41Q9C0J9 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BHLHE41Q9C0J9 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BHLHE41Q9C0J9 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
BHLHE41Q9C0J9 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.32■■□□□ 1
BHLHE41Q9C0J9 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BHLHE41Q9C0J9 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BHLHE41Q9C0J9 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
BHLHE41Q9C0J9 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
BHLHE41Q9C0J9 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BHLHE41Q9C0J9 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.32■■□□□ 1
BHLHE41Q9C0J9 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
BHLHE41Q9C0J9 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
BHLHE41Q9C0J9 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BHLHE41Q9C0J9 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
BHLHE41Q9C0J9 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
BHLHE41Q9C0J9 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BHLHE41Q9C0J9 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
BHLHE41Q9C0J9 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
BHLHE41Q9C0J9 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
BHLHE41Q9C0J9 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.31■■□□□ 1
BHLHE41Q9C0J9 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BHLHE41Q9C0J9 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BHLHE41Q9C0J9 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BHLHE41Q9C0J9 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BHLHE41Q9C0J9 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
BHLHE41Q9C0J9 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BHLHE41Q9C0J9 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
BHLHE41Q9C0J9 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BHLHE41Q9C0J9 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BHLHE41Q9C0J9 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BHLHE41Q9C0J9 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BHLHE41Q9C0J9 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BHLHE41Q9C0J9 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
BHLHE41Q9C0J9 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
BHLHE41Q9C0J9 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
BHLHE41Q9C0J9 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
BHLHE41Q9C0J9 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BHLHE41Q9C0J9 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
BHLHE41Q9C0J9 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BHLHE41Q9C0J9 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BHLHE41Q9C0J9 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BHLHE41Q9C0J9 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BHLHE41Q9C0J9 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms