Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL4Q9C0H6 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL4Q9C0H6 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL4Q9C0H6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL4Q9C0H6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL4Q9C0H6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL4Q9C0H6 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL4Q9C0H6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL4Q9C0H6 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL4Q9C0H6 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL4Q9C0H6 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHL4Q9C0H6 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHL4Q9C0H6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHL4Q9C0H6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHL4Q9C0H6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHL4Q9C0H6 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHL4Q9C0H6 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHL4Q9C0H6 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHL4Q9C0H6 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHL4Q9C0H6 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHL4Q9C0H6 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
KLHL4Q9C0H6 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
KLHL4Q9C0H6 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
KLHL4Q9C0H6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
KLHL4Q9C0H6 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
KLHL4Q9C0H6 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
KLHL4Q9C0H6 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KLHL4Q9C0H6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KLHL4Q9C0H6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KLHL4Q9C0H6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KLHL4Q9C0H6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
KLHL4Q9C0H6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KLHL4Q9C0H6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
KLHL4Q9C0H6 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KLHL4Q9C0H6 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KLHL4Q9C0H6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KLHL4Q9C0H6 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KLHL4Q9C0H6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KLHL4Q9C0H6 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KLHL4Q9C0H6 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL4Q9C0H6 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL4Q9C0H6 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL4Q9C0H6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL4Q9C0H6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL4Q9C0H6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL4Q9C0H6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL4Q9C0H6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL4Q9C0H6 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL4Q9C0H6 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL4Q9C0H6 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL4Q9C0H6 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL4Q9C0H6 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL4Q9C0H6 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL4Q9C0H6 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL4Q9C0H6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL4Q9C0H6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL4Q9C0H6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL4Q9C0H6 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL4Q9C0H6 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL4Q9C0H6 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL4Q9C0H6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL4Q9C0H6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL4Q9C0H6 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL4Q9C0H6 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL4Q9C0H6 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL4Q9C0H6 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL4Q9C0H6 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL4Q9C0H6 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHL4Q9C0H6 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHL4Q9C0H6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHL4Q9C0H6 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHL4Q9C0H6 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHL4Q9C0H6 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHL4Q9C0H6 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHL4Q9C0H6 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHL4Q9C0H6 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL4Q9C0H6 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL4Q9C0H6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL4Q9C0H6 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL4Q9C0H6 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL4Q9C0H6 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL4Q9C0H6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL4Q9C0H6 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL4Q9C0H6 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL4Q9C0H6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL4Q9C0H6 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL4Q9C0H6 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL4Q9C0H6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL4Q9C0H6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL4Q9C0H6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL4Q9C0H6 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL4Q9C0H6 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL4Q9C0H6 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL4Q9C0H6 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL4Q9C0H6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL4Q9C0H6 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL4Q9C0H6 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL4Q9C0H6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL4Q9C0H6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL4Q9C0H6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms