Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL4Q9C0H6 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL4Q9C0H6 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL4Q9C0H6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL4Q9C0H6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL4Q9C0H6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL4Q9C0H6 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL4Q9C0H6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL4Q9C0H6 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL4Q9C0H6 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL4Q9C0H6 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHL4Q9C0H6 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHL4Q9C0H6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHL4Q9C0H6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHL4Q9C0H6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHL4Q9C0H6 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHL4Q9C0H6 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHL4Q9C0H6 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHL4Q9C0H6 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHL4Q9C0H6 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHL4Q9C0H6 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
KLHL4Q9C0H6 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
KLHL4Q9C0H6 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
KLHL4Q9C0H6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
KLHL4Q9C0H6 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
KLHL4Q9C0H6 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
KLHL4Q9C0H6 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KLHL4Q9C0H6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KLHL4Q9C0H6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KLHL4Q9C0H6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KLHL4Q9C0H6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
KLHL4Q9C0H6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KLHL4Q9C0H6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
KLHL4Q9C0H6 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KLHL4Q9C0H6 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KLHL4Q9C0H6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KLHL4Q9C0H6 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KLHL4Q9C0H6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KLHL4Q9C0H6 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KLHL4Q9C0H6 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL4Q9C0H6 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL4Q9C0H6 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL4Q9C0H6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL4Q9C0H6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL4Q9C0H6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL4Q9C0H6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL4Q9C0H6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL4Q9C0H6 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL4Q9C0H6 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL4Q9C0H6 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL4Q9C0H6 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL4Q9C0H6 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL4Q9C0H6 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL4Q9C0H6 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL4Q9C0H6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL4Q9C0H6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL4Q9C0H6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL4Q9C0H6 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL4Q9C0H6 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL4Q9C0H6 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL4Q9C0H6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL4Q9C0H6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL4Q9C0H6 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL4Q9C0H6 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL4Q9C0H6 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL4Q9C0H6 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL4Q9C0H6 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL4Q9C0H6 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHL4Q9C0H6 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHL4Q9C0H6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHL4Q9C0H6 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHL4Q9C0H6 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHL4Q9C0H6 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHL4Q9C0H6 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHL4Q9C0H6 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHL4Q9C0H6 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL4Q9C0H6 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL4Q9C0H6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL4Q9C0H6 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL4Q9C0H6 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL4Q9C0H6 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL4Q9C0H6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL4Q9C0H6 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL4Q9C0H6 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL4Q9C0H6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL4Q9C0H6 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL4Q9C0H6 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL4Q9C0H6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL4Q9C0H6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL4Q9C0H6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL4Q9C0H6 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL4Q9C0H6 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL4Q9C0H6 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL4Q9C0H6 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL4Q9C0H6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL4Q9C0H6 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL4Q9C0H6 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL4Q9C0H6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL4Q9C0H6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL4Q9C0H6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms