Protein–RNA interactions for Protein: Q9C026

TRIM9, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM9, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM9Q9C026 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM9Q9C026 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM9Q9C026 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM9Q9C026 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM9Q9C026 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM9Q9C026 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM9Q9C026 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM9Q9C026 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM9Q9C026 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM9Q9C026 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM9Q9C026 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM9Q9C026 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM9Q9C026 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM9Q9C026 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM9Q9C026 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM9Q9C026 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM9Q9C026 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM9Q9C026 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM9Q9C026 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM9Q9C026 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM9Q9C026 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM9Q9C026 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM9Q9C026 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM9Q9C026 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM9Q9C026 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM9Q9C026 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM9Q9C026 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM9Q9C026 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM9Q9C026 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM9Q9C026 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM9Q9C026 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM9Q9C026 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM9Q9C026 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM9Q9C026 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM9Q9C026 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM9Q9C026 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM9Q9C026 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM9Q9C026 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM9Q9C026 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM9Q9C026 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIM9Q9C026 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIM9Q9C026 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIM9Q9C026 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TRIM9Q9C026 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TRIM9Q9C026 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TRIM9Q9C026 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
TRIM9Q9C026 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TRIM9Q9C026 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM9Q9C026 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM9Q9C026 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM9Q9C026 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM9Q9C026 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM9Q9C026 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM9Q9C026 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM9Q9C026 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM9Q9C026 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM9Q9C026 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM9Q9C026 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM9Q9C026 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM9Q9C026 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM9Q9C026 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM9Q9C026 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM9Q9C026 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM9Q9C026 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM9Q9C026 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM9Q9C026 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM9Q9C026 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM9Q9C026 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM9Q9C026 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM9Q9C026 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM9Q9C026 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM9Q9C026 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM9Q9C026 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM9Q9C026 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM9Q9C026 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM9Q9C026 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM9Q9C026 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM9Q9C026 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM9Q9C026 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM9Q9C026 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM9Q9C026 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM9Q9C026 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM9Q9C026 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM9Q9C026 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM9Q9C026 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM9Q9C026 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM9Q9C026 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM9Q9C026 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM9Q9C026 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM9Q9C026 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM9Q9C026 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM9Q9C026 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM9Q9C026 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM9Q9C026 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM9Q9C026 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM9Q9C026 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TRIM9Q9C026 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TRIM9Q9C026 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TRIM9Q9C026 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
TRIM9Q9C026 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms