Protein–RNA interactions for Protein: Q9C002

NMES1, Normal mucosa of esophagus-specific gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMES1Q9C002 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NMES1Q9C002 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NMES1Q9C002 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NMES1Q9C002 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NMES1Q9C002 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NMES1Q9C002 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NMES1Q9C002 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NMES1Q9C002 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NMES1Q9C002 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NMES1Q9C002 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NMES1Q9C002 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NMES1Q9C002 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NMES1Q9C002 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NMES1Q9C002 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NMES1Q9C002 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NMES1Q9C002 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NMES1Q9C002 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NMES1Q9C002 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NMES1Q9C002 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NMES1Q9C002 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NMES1Q9C002 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NMES1Q9C002 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NMES1Q9C002 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NMES1Q9C002 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NMES1Q9C002 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NMES1Q9C002 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NMES1Q9C002 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NMES1Q9C002 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NMES1Q9C002 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NMES1Q9C002 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NMES1Q9C002 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NMES1Q9C002 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NMES1Q9C002 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NMES1Q9C002 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
NMES1Q9C002 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NMES1Q9C002 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NMES1Q9C002 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NMES1Q9C002 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NMES1Q9C002 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NMES1Q9C002 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NMES1Q9C002 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NMES1Q9C002 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NMES1Q9C002 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NMES1Q9C002 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NMES1Q9C002 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NMES1Q9C002 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NMES1Q9C002 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NMES1Q9C002 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NMES1Q9C002 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NMES1Q9C002 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NMES1Q9C002 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NMES1Q9C002 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NMES1Q9C002 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NMES1Q9C002 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NMES1Q9C002 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NMES1Q9C002 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
NMES1Q9C002 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NMES1Q9C002 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NMES1Q9C002 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NMES1Q9C002 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NMES1Q9C002 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NMES1Q9C002 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NMES1Q9C002 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NMES1Q9C002 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NMES1Q9C002 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NMES1Q9C002 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NMES1Q9C002 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NMES1Q9C002 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NMES1Q9C002 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NMES1Q9C002 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NMES1Q9C002 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NMES1Q9C002 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NMES1Q9C002 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NMES1Q9C002 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NMES1Q9C002 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NMES1Q9C002 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NMES1Q9C002 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
NMES1Q9C002 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NMES1Q9C002 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NMES1Q9C002 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NMES1Q9C002 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NMES1Q9C002 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NMES1Q9C002 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NMES1Q9C002 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NMES1Q9C002 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NMES1Q9C002 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NMES1Q9C002 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NMES1Q9C002 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NMES1Q9C002 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NMES1Q9C002 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NMES1Q9C002 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NMES1Q9C002 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NMES1Q9C002 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NMES1Q9C002 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NMES1Q9C002 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NMES1Q9C002 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NMES1Q9C002 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NMES1Q9C002 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NMES1Q9C002 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NMES1Q9C002 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.9 ms