Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZS1

FOXP3, Forkhead box protein P3, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXP3Q9BZS1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXP3Q9BZS1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXP3Q9BZS1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXP3Q9BZS1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXP3Q9BZS1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXP3Q9BZS1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXP3Q9BZS1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXP3Q9BZS1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOXP3Q9BZS1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOXP3Q9BZS1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOXP3Q9BZS1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
FOXP3Q9BZS1 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOXP3Q9BZS1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOXP3Q9BZS1 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOXP3Q9BZS1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOXP3Q9BZS1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOXP3Q9BZS1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOXP3Q9BZS1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOXP3Q9BZS1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOXP3Q9BZS1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOXP3Q9BZS1 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOXP3Q9BZS1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOXP3Q9BZS1 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
FOXP3Q9BZS1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FOXP3Q9BZS1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FOXP3Q9BZS1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FOXP3Q9BZS1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FOXP3Q9BZS1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FOXP3Q9BZS1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FOXP3Q9BZS1 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FOXP3Q9BZS1 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FOXP3Q9BZS1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FOXP3Q9BZS1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FOXP3Q9BZS1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOXP3Q9BZS1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOXP3Q9BZS1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOXP3Q9BZS1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOXP3Q9BZS1 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOXP3Q9BZS1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOXP3Q9BZS1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
FOXP3Q9BZS1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOXP3Q9BZS1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOXP3Q9BZS1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FOXP3Q9BZS1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FOXP3Q9BZS1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FOXP3Q9BZS1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FOXP3Q9BZS1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FOXP3Q9BZS1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FOXP3Q9BZS1 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FOXP3Q9BZS1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FOXP3Q9BZS1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FOXP3Q9BZS1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FOXP3Q9BZS1 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FOXP3Q9BZS1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FOXP3Q9BZS1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FOXP3Q9BZS1 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FOXP3Q9BZS1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FOXP3Q9BZS1 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FOXP3Q9BZS1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FOXP3Q9BZS1 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FOXP3Q9BZS1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FOXP3Q9BZS1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FOXP3Q9BZS1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FOXP3Q9BZS1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FOXP3Q9BZS1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FOXP3Q9BZS1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FOXP3Q9BZS1 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FOXP3Q9BZS1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FOXP3Q9BZS1 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FOXP3Q9BZS1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FOXP3Q9BZS1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOXP3Q9BZS1 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
FOXP3Q9BZS1 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOXP3Q9BZS1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOXP3Q9BZS1 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOXP3Q9BZS1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOXP3Q9BZS1 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOXP3Q9BZS1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOXP3Q9BZS1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FOXP3Q9BZS1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FOXP3Q9BZS1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FOXP3Q9BZS1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FOXP3Q9BZS1 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FOXP3Q9BZS1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FOXP3Q9BZS1 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FOXP3Q9BZS1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FOXP3Q9BZS1 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FOXP3Q9BZS1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOXP3Q9BZS1 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOXP3Q9BZS1 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
FOXP3Q9BZS1 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOXP3Q9BZS1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOXP3Q9BZS1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOXP3Q9BZS1 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOXP3Q9BZS1 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOXP3Q9BZS1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOXP3Q9BZS1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOXP3Q9BZS1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FOXP3Q9BZS1 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FOXP3Q9BZS1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms