Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM54Q9BYV2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM54Q9BYV2 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM54Q9BYV2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM54Q9BYV2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM54Q9BYV2 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM54Q9BYV2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM54Q9BYV2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM54Q9BYV2 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM54Q9BYV2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM54Q9BYV2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM54Q9BYV2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM54Q9BYV2 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM54Q9BYV2 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM54Q9BYV2 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM54Q9BYV2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM54Q9BYV2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM54Q9BYV2 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM54Q9BYV2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM54Q9BYV2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM54Q9BYV2 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM54Q9BYV2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM54Q9BYV2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM54Q9BYV2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM54Q9BYV2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM54Q9BYV2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM54Q9BYV2 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM54Q9BYV2 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM54Q9BYV2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM54Q9BYV2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM54Q9BYV2 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM54Q9BYV2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM54Q9BYV2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM54Q9BYV2 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM54Q9BYV2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM54Q9BYV2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM54Q9BYV2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM54Q9BYV2 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM54Q9BYV2 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM54Q9BYV2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM54Q9BYV2 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM54Q9BYV2 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM54Q9BYV2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM54Q9BYV2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM54Q9BYV2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM54Q9BYV2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM54Q9BYV2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM54Q9BYV2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM54Q9BYV2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM54Q9BYV2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM54Q9BYV2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM54Q9BYV2 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM54Q9BYV2 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM54Q9BYV2 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM54Q9BYV2 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM54Q9BYV2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM54Q9BYV2 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM54Q9BYV2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM54Q9BYV2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM54Q9BYV2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM54Q9BYV2 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM54Q9BYV2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM54Q9BYV2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM54Q9BYV2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM54Q9BYV2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM54Q9BYV2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM54Q9BYV2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM54Q9BYV2 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM54Q9BYV2 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM54Q9BYV2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM54Q9BYV2 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM54Q9BYV2 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM54Q9BYV2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM54Q9BYV2 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM54Q9BYV2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM54Q9BYV2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM54Q9BYV2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM54Q9BYV2 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM54Q9BYV2 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM54Q9BYV2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRIM54Q9BYV2 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRIM54Q9BYV2 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM54Q9BYV2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM54Q9BYV2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM54Q9BYV2 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM54Q9BYV2 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM54Q9BYV2 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM54Q9BYV2 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM54Q9BYV2 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM54Q9BYV2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM54Q9BYV2 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM54Q9BYV2 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM54Q9BYV2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM54Q9BYV2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM54Q9BYV2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM54Q9BYV2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM54Q9BYV2 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM54Q9BYV2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM54Q9BYV2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM54Q9BYV2 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms