Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY41

HDAC8, Histone deacetylase 8, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8Q9BY41 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDAC8Q9BY41 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDAC8Q9BY41 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDAC8Q9BY41 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
HDAC8Q9BY41 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDAC8Q9BY41 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDAC8Q9BY41 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDAC8Q9BY41 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDAC8Q9BY41 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HDAC8Q9BY41 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HDAC8Q9BY41 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HDAC8Q9BY41 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HDAC8Q9BY41 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HDAC8Q9BY41 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HDAC8Q9BY41 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HDAC8Q9BY41 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HDAC8Q9BY41 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HDAC8Q9BY41 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HDAC8Q9BY41 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HDAC8Q9BY41 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
HDAC8Q9BY41 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
HDAC8Q9BY41 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HDAC8Q9BY41 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HDAC8Q9BY41 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC8Q9BY41 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC8Q9BY41 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC8Q9BY41 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC8Q9BY41 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC8Q9BY41 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC8Q9BY41 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC8Q9BY41 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC8Q9BY41 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC8Q9BY41 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC8Q9BY41 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC8Q9BY41 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC8Q9BY41 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC8Q9BY41 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC8Q9BY41 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC8Q9BY41 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC8Q9BY41 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HDAC8Q9BY41 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HDAC8Q9BY41 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HDAC8Q9BY41 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HDAC8Q9BY41 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
HDAC8Q9BY41 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HDAC8Q9BY41 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HDAC8Q9BY41 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HDAC8Q9BY41 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HDAC8Q9BY41 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HDAC8Q9BY41 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HDAC8Q9BY41 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HDAC8Q9BY41 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HDAC8Q9BY41 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HDAC8Q9BY41 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HDAC8Q9BY41 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
HDAC8Q9BY41 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
HDAC8Q9BY41 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HDAC8Q9BY41 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HDAC8Q9BY41 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HDAC8Q9BY41 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HDAC8Q9BY41 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HDAC8Q9BY41 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HDAC8Q9BY41 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HDAC8Q9BY41 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HDAC8Q9BY41 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HDAC8Q9BY41 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HDAC8Q9BY41 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HDAC8Q9BY41 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HDAC8Q9BY41 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HDAC8Q9BY41 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HDAC8Q9BY41 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HDAC8Q9BY41 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HDAC8Q9BY41 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HDAC8Q9BY41 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HDAC8Q9BY41 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HDAC8Q9BY41 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HDAC8Q9BY41 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HDAC8Q9BY41 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HDAC8Q9BY41 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HDAC8Q9BY41 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HDAC8Q9BY41 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HDAC8Q9BY41 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HDAC8Q9BY41 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HDAC8Q9BY41 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HDAC8Q9BY41 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HDAC8Q9BY41 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HDAC8Q9BY41 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HDAC8Q9BY41 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HDAC8Q9BY41 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HDAC8Q9BY41 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HDAC8Q9BY41 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HDAC8Q9BY41 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HDAC8Q9BY41 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HDAC8Q9BY41 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HDAC8Q9BY41 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDAC8Q9BY41 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDAC8Q9BY41 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDAC8Q9BY41 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDAC8Q9BY41 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDAC8Q9BY41 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms