Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP2

SLC12A9, Solute carrier family 12 member 9, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A9Q9BXP2 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC12A9Q9BXP2 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC12A9Q9BXP2 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC12A9Q9BXP2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC12A9Q9BXP2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC12A9Q9BXP2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC12A9Q9BXP2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC12A9Q9BXP2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC12A9Q9BXP2 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC12A9Q9BXP2 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC12A9Q9BXP2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC12A9Q9BXP2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SLC12A9Q9BXP2 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC12A9Q9BXP2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC12A9Q9BXP2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC12A9Q9BXP2 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC12A9Q9BXP2 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC12A9Q9BXP2 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC12A9Q9BXP2 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC12A9Q9BXP2 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC12A9Q9BXP2 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC12A9Q9BXP2 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC12A9Q9BXP2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC12A9Q9BXP2 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC12A9Q9BXP2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC12A9Q9BXP2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC12A9Q9BXP2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC12A9Q9BXP2 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC12A9Q9BXP2 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC12A9Q9BXP2 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC12A9Q9BXP2 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC12A9Q9BXP2 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC12A9Q9BXP2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC12A9Q9BXP2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC12A9Q9BXP2 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC12A9Q9BXP2 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC12A9Q9BXP2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC12A9Q9BXP2 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC12A9Q9BXP2 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC12A9Q9BXP2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC12A9Q9BXP2 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC12A9Q9BXP2 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC12A9Q9BXP2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC12A9Q9BXP2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC12A9Q9BXP2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC12A9Q9BXP2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC12A9Q9BXP2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC12A9Q9BXP2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC12A9Q9BXP2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC12A9Q9BXP2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC12A9Q9BXP2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC12A9Q9BXP2 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC12A9Q9BXP2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC12A9Q9BXP2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC12A9Q9BXP2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC12A9Q9BXP2 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC12A9Q9BXP2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC12A9Q9BXP2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC12A9Q9BXP2 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC12A9Q9BXP2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC12A9Q9BXP2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC12A9Q9BXP2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC12A9Q9BXP2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC12A9Q9BXP2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC12A9Q9BXP2 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC12A9Q9BXP2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC12A9Q9BXP2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC12A9Q9BXP2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC12A9Q9BXP2 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC12A9Q9BXP2 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC12A9Q9BXP2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC12A9Q9BXP2 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC12A9Q9BXP2 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC12A9Q9BXP2 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC12A9Q9BXP2 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC12A9Q9BXP2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC12A9Q9BXP2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC12A9Q9BXP2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC12A9Q9BXP2 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC12A9Q9BXP2 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC12A9Q9BXP2 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC12A9Q9BXP2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC12A9Q9BXP2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC12A9Q9BXP2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC12A9Q9BXP2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC12A9Q9BXP2 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC12A9Q9BXP2 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC12A9Q9BXP2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC12A9Q9BXP2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC12A9Q9BXP2 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC12A9Q9BXP2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC12A9Q9BXP2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC12A9Q9BXP2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC12A9Q9BXP2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC12A9Q9BXP2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC12A9Q9BXP2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC12A9Q9BXP2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC12A9Q9BXP2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC12A9Q9BXP2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC12A9Q9BXP2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms