Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWX5

GATA5, Transcription factor GATA-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA5Q9BWX5 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GATA5Q9BWX5 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GATA5Q9BWX5 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GATA5Q9BWX5 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GATA5Q9BWX5 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GATA5Q9BWX5 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GATA5Q9BWX5 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GATA5Q9BWX5 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GATA5Q9BWX5 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GATA5Q9BWX5 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GATA5Q9BWX5 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GATA5Q9BWX5 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GATA5Q9BWX5 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GATA5Q9BWX5 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GATA5Q9BWX5 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GATA5Q9BWX5 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GATA5Q9BWX5 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GATA5Q9BWX5 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GATA5Q9BWX5 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GATA5Q9BWX5 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GATA5Q9BWX5 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GATA5Q9BWX5 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GATA5Q9BWX5 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GATA5Q9BWX5 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GATA5Q9BWX5 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GATA5Q9BWX5 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GATA5Q9BWX5 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GATA5Q9BWX5 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GATA5Q9BWX5 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GATA5Q9BWX5 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GATA5Q9BWX5 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GATA5Q9BWX5 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GATA5Q9BWX5 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GATA5Q9BWX5 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GATA5Q9BWX5 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GATA5Q9BWX5 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GATA5Q9BWX5 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GATA5Q9BWX5 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GATA5Q9BWX5 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GATA5Q9BWX5 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GATA5Q9BWX5 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GATA5Q9BWX5 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GATA5Q9BWX5 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GATA5Q9BWX5 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GATA5Q9BWX5 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GATA5Q9BWX5 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GATA5Q9BWX5 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GATA5Q9BWX5 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GATA5Q9BWX5 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GATA5Q9BWX5 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GATA5Q9BWX5 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GATA5Q9BWX5 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GATA5Q9BWX5 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GATA5Q9BWX5 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GATA5Q9BWX5 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GATA5Q9BWX5 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GATA5Q9BWX5 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GATA5Q9BWX5 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GATA5Q9BWX5 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GATA5Q9BWX5 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GATA5Q9BWX5 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GATA5Q9BWX5 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GATA5Q9BWX5 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GATA5Q9BWX5 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GATA5Q9BWX5 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GATA5Q9BWX5 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GATA5Q9BWX5 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GATA5Q9BWX5 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GATA5Q9BWX5 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GATA5Q9BWX5 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GATA5Q9BWX5 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GATA5Q9BWX5 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GATA5Q9BWX5 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GATA5Q9BWX5 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GATA5Q9BWX5 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GATA5Q9BWX5 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GATA5Q9BWX5 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GATA5Q9BWX5 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GATA5Q9BWX5 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GATA5Q9BWX5 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GATA5Q9BWX5 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GATA5Q9BWX5 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GATA5Q9BWX5 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GATA5Q9BWX5 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GATA5Q9BWX5 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GATA5Q9BWX5 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GATA5Q9BWX5 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GATA5Q9BWX5 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GATA5Q9BWX5 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GATA5Q9BWX5 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GATA5Q9BWX5 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GATA5Q9BWX5 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GATA5Q9BWX5 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GATA5Q9BWX5 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GATA5Q9BWX5 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GATA5Q9BWX5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GATA5Q9BWX5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GATA5Q9BWX5 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GATA5Q9BWX5 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GATA5Q9BWX5 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.3 ms