Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA1

TUBB2B, Tubulin beta-2B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB2BQ9BVA1 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TUBB2BQ9BVA1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TUBB2BQ9BVA1 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TUBB2BQ9BVA1 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TUBB2BQ9BVA1 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TUBB2BQ9BVA1 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TUBB2BQ9BVA1 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TUBB2BQ9BVA1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TUBB2BQ9BVA1 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TUBB2BQ9BVA1 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TUBB2BQ9BVA1 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TUBB2BQ9BVA1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TUBB2BQ9BVA1 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TUBB2BQ9BVA1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TUBB2BQ9BVA1 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TUBB2BQ9BVA1 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TUBB2BQ9BVA1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TUBB2BQ9BVA1 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TUBB2BQ9BVA1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TUBB2BQ9BVA1 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TUBB2BQ9BVA1 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TUBB2BQ9BVA1 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TUBB2BQ9BVA1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TUBB2BQ9BVA1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TUBB2BQ9BVA1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TUBB2BQ9BVA1 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TUBB2BQ9BVA1 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TUBB2BQ9BVA1 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TUBB2BQ9BVA1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TUBB2BQ9BVA1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TUBB2BQ9BVA1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TUBB2BQ9BVA1 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TUBB2BQ9BVA1 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TUBB2BQ9BVA1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TUBB2BQ9BVA1 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TUBB2BQ9BVA1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TUBB2BQ9BVA1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TUBB2BQ9BVA1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TUBB2BQ9BVA1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TUBB2BQ9BVA1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TUBB2BQ9BVA1 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TUBB2BQ9BVA1 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TUBB2BQ9BVA1 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TUBB2BQ9BVA1 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TUBB2BQ9BVA1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TUBB2BQ9BVA1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TUBB2BQ9BVA1 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TUBB2BQ9BVA1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TUBB2BQ9BVA1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TUBB2BQ9BVA1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TUBB2BQ9BVA1 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TUBB2BQ9BVA1 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TUBB2BQ9BVA1 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TUBB2BQ9BVA1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TUBB2BQ9BVA1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TUBB2BQ9BVA1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TUBB2BQ9BVA1 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TUBB2BQ9BVA1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TUBB2BQ9BVA1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TUBB2BQ9BVA1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TUBB2BQ9BVA1 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TUBB2BQ9BVA1 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TUBB2BQ9BVA1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TUBB2BQ9BVA1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TUBB2BQ9BVA1 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TUBB2BQ9BVA1 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TUBB2BQ9BVA1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TUBB2BQ9BVA1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TUBB2BQ9BVA1 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TUBB2BQ9BVA1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TUBB2BQ9BVA1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TUBB2BQ9BVA1 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TUBB2BQ9BVA1 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TUBB2BQ9BVA1 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TUBB2BQ9BVA1 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TUBB2BQ9BVA1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TUBB2BQ9BVA1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TUBB2BQ9BVA1 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TUBB2BQ9BVA1 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TUBB2BQ9BVA1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TUBB2BQ9BVA1 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TUBB2BQ9BVA1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TUBB2BQ9BVA1 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TUBB2BQ9BVA1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TUBB2BQ9BVA1 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TUBB2BQ9BVA1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TUBB2BQ9BVA1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TUBB2BQ9BVA1 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TUBB2BQ9BVA1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TUBB2BQ9BVA1 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TUBB2BQ9BVA1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TUBB2BQ9BVA1 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TUBB2BQ9BVA1 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TUBB2BQ9BVA1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TUBB2BQ9BVA1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TUBB2BQ9BVA1 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TUBB2BQ9BVA1 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TUBB2BQ9BVA1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TUBB2BQ9BVA1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TUBB2BQ9BVA1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms