Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV99

LRRC61, Leucine-rich repeat-containing protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC61Q9BV99 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC61Q9BV99 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC61Q9BV99 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC61Q9BV99 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC61Q9BV99 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC61Q9BV99 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC61Q9BV99 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC61Q9BV99 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC61Q9BV99 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC61Q9BV99 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC61Q9BV99 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC61Q9BV99 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC61Q9BV99 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC61Q9BV99 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC61Q9BV99 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC61Q9BV99 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC61Q9BV99 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC61Q9BV99 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC61Q9BV99 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC61Q9BV99 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC61Q9BV99 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC61Q9BV99 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC61Q9BV99 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC61Q9BV99 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC61Q9BV99 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC61Q9BV99 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC61Q9BV99 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC61Q9BV99 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC61Q9BV99 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC61Q9BV99 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC61Q9BV99 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC61Q9BV99 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC61Q9BV99 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC61Q9BV99 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC61Q9BV99 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC61Q9BV99 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC61Q9BV99 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC61Q9BV99 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC61Q9BV99 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC61Q9BV99 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC61Q9BV99 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC61Q9BV99 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC61Q9BV99 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC61Q9BV99 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRRC61Q9BV99 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRRC61Q9BV99 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRRC61Q9BV99 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRRC61Q9BV99 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRRC61Q9BV99 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC61Q9BV99 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC61Q9BV99 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC61Q9BV99 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC61Q9BV99 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC61Q9BV99 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC61Q9BV99 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC61Q9BV99 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC61Q9BV99 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC61Q9BV99 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC61Q9BV99 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC61Q9BV99 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC61Q9BV99 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC61Q9BV99 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC61Q9BV99 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC61Q9BV99 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC61Q9BV99 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC61Q9BV99 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC61Q9BV99 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC61Q9BV99 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC61Q9BV99 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC61Q9BV99 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC61Q9BV99 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC61Q9BV99 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC61Q9BV99 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC61Q9BV99 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC61Q9BV99 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC61Q9BV99 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC61Q9BV99 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC61Q9BV99 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC61Q9BV99 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC61Q9BV99 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC61Q9BV99 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC61Q9BV99 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC61Q9BV99 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC61Q9BV99 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC61Q9BV99 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC61Q9BV99 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC61Q9BV99 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC61Q9BV99 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC61Q9BV99 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC61Q9BV99 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC61Q9BV99 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC61Q9BV99 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC61Q9BV99 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC61Q9BV99 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC61Q9BV99 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC61Q9BV99 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC61Q9BV99 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC61Q9BV99 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC61Q9BV99 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC61Q9BV99 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms