Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV19

C1orf50, Uncharacterized protein C1orf50, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf50Q9BV19 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C1orf50Q9BV19 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C1orf50Q9BV19 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C1orf50Q9BV19 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
C1orf50Q9BV19 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C1orf50Q9BV19 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C1orf50Q9BV19 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C1orf50Q9BV19 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
C1orf50Q9BV19 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C1orf50Q9BV19 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C1orf50Q9BV19 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
C1orf50Q9BV19 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C1orf50Q9BV19 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
C1orf50Q9BV19 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
C1orf50Q9BV19 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
C1orf50Q9BV19 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
C1orf50Q9BV19 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C1orf50Q9BV19 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C1orf50Q9BV19 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
C1orf50Q9BV19 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C1orf50Q9BV19 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C1orf50Q9BV19 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C1orf50Q9BV19 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
C1orf50Q9BV19 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
C1orf50Q9BV19 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
C1orf50Q9BV19 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
C1orf50Q9BV19 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C1orf50Q9BV19 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C1orf50Q9BV19 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C1orf50Q9BV19 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
C1orf50Q9BV19 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
C1orf50Q9BV19 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
C1orf50Q9BV19 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C1orf50Q9BV19 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
C1orf50Q9BV19 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C1orf50Q9BV19 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C1orf50Q9BV19 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C1orf50Q9BV19 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C1orf50Q9BV19 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C1orf50Q9BV19 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
C1orf50Q9BV19 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C1orf50Q9BV19 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
C1orf50Q9BV19 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C1orf50Q9BV19 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
C1orf50Q9BV19 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C1orf50Q9BV19 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
C1orf50Q9BV19 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C1orf50Q9BV19 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
C1orf50Q9BV19 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
C1orf50Q9BV19 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
C1orf50Q9BV19 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
C1orf50Q9BV19 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C1orf50Q9BV19 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
C1orf50Q9BV19 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C1orf50Q9BV19 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C1orf50Q9BV19 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C1orf50Q9BV19 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C1orf50Q9BV19 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
C1orf50Q9BV19 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C1orf50Q9BV19 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
C1orf50Q9BV19 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
C1orf50Q9BV19 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C1orf50Q9BV19 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C1orf50Q9BV19 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C1orf50Q9BV19 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C1orf50Q9BV19 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C1orf50Q9BV19 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C1orf50Q9BV19 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
C1orf50Q9BV19 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C1orf50Q9BV19 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
C1orf50Q9BV19 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
C1orf50Q9BV19 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
C1orf50Q9BV19 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
C1orf50Q9BV19 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
C1orf50Q9BV19 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C1orf50Q9BV19 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C1orf50Q9BV19 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
C1orf50Q9BV19 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C1orf50Q9BV19 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C1orf50Q9BV19 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C1orf50Q9BV19 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C1orf50Q9BV19 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
C1orf50Q9BV19 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C1orf50Q9BV19 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
C1orf50Q9BV19 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C1orf50Q9BV19 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C1orf50Q9BV19 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C1orf50Q9BV19 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
C1orf50Q9BV19 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C1orf50Q9BV19 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
C1orf50Q9BV19 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
C1orf50Q9BV19 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C1orf50Q9BV19 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
C1orf50Q9BV19 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C1orf50Q9BV19 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
C1orf50Q9BV19 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C1orf50Q9BV19 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C1orf50Q9BV19 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C1orf50Q9BV19 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
C1orf50Q9BV19 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms