Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUV0

RSRP1, Arginine/serine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSRP1Q9BUV0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
RSRP1Q9BUV0 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RSRP1Q9BUV0 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RSRP1Q9BUV0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RSRP1Q9BUV0 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
RSRP1Q9BUV0 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RSRP1Q9BUV0 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RSRP1Q9BUV0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RSRP1Q9BUV0 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RSRP1Q9BUV0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RSRP1Q9BUV0 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RSRP1Q9BUV0 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RSRP1Q9BUV0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
RSRP1Q9BUV0 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RSRP1Q9BUV0 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RSRP1Q9BUV0 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RSRP1Q9BUV0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RSRP1Q9BUV0 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RSRP1Q9BUV0 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RSRP1Q9BUV0 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RSRP1Q9BUV0 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RSRP1Q9BUV0 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RSRP1Q9BUV0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RSRP1Q9BUV0 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RSRP1Q9BUV0 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RSRP1Q9BUV0 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RSRP1Q9BUV0 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RSRP1Q9BUV0 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
RSRP1Q9BUV0 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RSRP1Q9BUV0 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RSRP1Q9BUV0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RSRP1Q9BUV0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
RSRP1Q9BUV0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
RSRP1Q9BUV0 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RSRP1Q9BUV0 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RSRP1Q9BUV0 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RSRP1Q9BUV0 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RSRP1Q9BUV0 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
RSRP1Q9BUV0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RSRP1Q9BUV0 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RSRP1Q9BUV0 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RSRP1Q9BUV0 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RSRP1Q9BUV0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RSRP1Q9BUV0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RSRP1Q9BUV0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RSRP1Q9BUV0 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RSRP1Q9BUV0 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RSRP1Q9BUV0 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
RSRP1Q9BUV0 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RSRP1Q9BUV0 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RSRP1Q9BUV0 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RSRP1Q9BUV0 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RSRP1Q9BUV0 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RSRP1Q9BUV0 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RSRP1Q9BUV0 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RSRP1Q9BUV0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RSRP1Q9BUV0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RSRP1Q9BUV0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RSRP1Q9BUV0 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RSRP1Q9BUV0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RSRP1Q9BUV0 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RSRP1Q9BUV0 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RSRP1Q9BUV0 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RSRP1Q9BUV0 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RSRP1Q9BUV0 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RSRP1Q9BUV0 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RSRP1Q9BUV0 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RSRP1Q9BUV0 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RSRP1Q9BUV0 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RSRP1Q9BUV0 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RSRP1Q9BUV0 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RSRP1Q9BUV0 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RSRP1Q9BUV0 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RSRP1Q9BUV0 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RSRP1Q9BUV0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RSRP1Q9BUV0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RSRP1Q9BUV0 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RSRP1Q9BUV0 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RSRP1Q9BUV0 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RSRP1Q9BUV0 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RSRP1Q9BUV0 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RSRP1Q9BUV0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RSRP1Q9BUV0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RSRP1Q9BUV0 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RSRP1Q9BUV0 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RSRP1Q9BUV0 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RSRP1Q9BUV0 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RSRP1Q9BUV0 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RSRP1Q9BUV0 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RSRP1Q9BUV0 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RSRP1Q9BUV0 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RSRP1Q9BUV0 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RSRP1Q9BUV0 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RSRP1Q9BUV0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RSRP1Q9BUV0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RSRP1Q9BUV0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RSRP1Q9BUV0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RSRP1Q9BUV0 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RSRP1Q9BUV0 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RSRP1Q9BUV0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms