Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUP0

EFHD1, EF-hand domain-containing protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD1Q9BUP0 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
EFHD1Q9BUP0 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EFHD1Q9BUP0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EFHD1Q9BUP0 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EFHD1Q9BUP0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EFHD1Q9BUP0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EFHD1Q9BUP0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EFHD1Q9BUP0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EFHD1Q9BUP0 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EFHD1Q9BUP0 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EFHD1Q9BUP0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EFHD1Q9BUP0 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EFHD1Q9BUP0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EFHD1Q9BUP0 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EFHD1Q9BUP0 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EFHD1Q9BUP0 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EFHD1Q9BUP0 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EFHD1Q9BUP0 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EFHD1Q9BUP0 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EFHD1Q9BUP0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EFHD1Q9BUP0 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EFHD1Q9BUP0 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EFHD1Q9BUP0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EFHD1Q9BUP0 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EFHD1Q9BUP0 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EFHD1Q9BUP0 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EFHD1Q9BUP0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
EFHD1Q9BUP0 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EFHD1Q9BUP0 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EFHD1Q9BUP0 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EFHD1Q9BUP0 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EFHD1Q9BUP0 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EFHD1Q9BUP0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EFHD1Q9BUP0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EFHD1Q9BUP0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EFHD1Q9BUP0 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EFHD1Q9BUP0 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
EFHD1Q9BUP0 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EFHD1Q9BUP0 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EFHD1Q9BUP0 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EFHD1Q9BUP0 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EFHD1Q9BUP0 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EFHD1Q9BUP0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EFHD1Q9BUP0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EFHD1Q9BUP0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EFHD1Q9BUP0 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EFHD1Q9BUP0 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EFHD1Q9BUP0 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EFHD1Q9BUP0 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EFHD1Q9BUP0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EFHD1Q9BUP0 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EFHD1Q9BUP0 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EFHD1Q9BUP0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EFHD1Q9BUP0 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EFHD1Q9BUP0 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EFHD1Q9BUP0 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EFHD1Q9BUP0 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EFHD1Q9BUP0 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EFHD1Q9BUP0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EFHD1Q9BUP0 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EFHD1Q9BUP0 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EFHD1Q9BUP0 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EFHD1Q9BUP0 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EFHD1Q9BUP0 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EFHD1Q9BUP0 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EFHD1Q9BUP0 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EFHD1Q9BUP0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EFHD1Q9BUP0 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EFHD1Q9BUP0 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EFHD1Q9BUP0 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EFHD1Q9BUP0 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EFHD1Q9BUP0 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EFHD1Q9BUP0 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EFHD1Q9BUP0 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EFHD1Q9BUP0 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EFHD1Q9BUP0 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EFHD1Q9BUP0 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EFHD1Q9BUP0 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EFHD1Q9BUP0 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EFHD1Q9BUP0 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EFHD1Q9BUP0 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EFHD1Q9BUP0 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EFHD1Q9BUP0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EFHD1Q9BUP0 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EFHD1Q9BUP0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EFHD1Q9BUP0 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EFHD1Q9BUP0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EFHD1Q9BUP0 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EFHD1Q9BUP0 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EFHD1Q9BUP0 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EFHD1Q9BUP0 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EFHD1Q9BUP0 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EFHD1Q9BUP0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EFHD1Q9BUP0 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
EFHD1Q9BUP0 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EFHD1Q9BUP0 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EFHD1Q9BUP0 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EFHD1Q9BUP0 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EFHD1Q9BUP0 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EFHD1Q9BUP0 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms