Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU40

CHRDL1, Chordin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRDL1Q9BU40 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHRDL1Q9BU40 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHRDL1Q9BU40 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHRDL1Q9BU40 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHRDL1Q9BU40 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHRDL1Q9BU40 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHRDL1Q9BU40 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHRDL1Q9BU40 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHRDL1Q9BU40 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHRDL1Q9BU40 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CHRDL1Q9BU40 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHRDL1Q9BU40 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CHRDL1Q9BU40 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHRDL1Q9BU40 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHRDL1Q9BU40 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHRDL1Q9BU40 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHRDL1Q9BU40 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHRDL1Q9BU40 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHRDL1Q9BU40 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHRDL1Q9BU40 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHRDL1Q9BU40 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHRDL1Q9BU40 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHRDL1Q9BU40 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHRDL1Q9BU40 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHRDL1Q9BU40 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHRDL1Q9BU40 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHRDL1Q9BU40 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHRDL1Q9BU40 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHRDL1Q9BU40 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHRDL1Q9BU40 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHRDL1Q9BU40 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHRDL1Q9BU40 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHRDL1Q9BU40 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHRDL1Q9BU40 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHRDL1Q9BU40 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHRDL1Q9BU40 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHRDL1Q9BU40 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHRDL1Q9BU40 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHRDL1Q9BU40 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CHRDL1Q9BU40 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHRDL1Q9BU40 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHRDL1Q9BU40 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRDL1Q9BU40 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRDL1Q9BU40 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRDL1Q9BU40 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRDL1Q9BU40 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRDL1Q9BU40 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRDL1Q9BU40 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRDL1Q9BU40 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRDL1Q9BU40 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRDL1Q9BU40 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRDL1Q9BU40 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRDL1Q9BU40 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRDL1Q9BU40 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRDL1Q9BU40 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRDL1Q9BU40 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRDL1Q9BU40 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRDL1Q9BU40 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRDL1Q9BU40 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRDL1Q9BU40 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRDL1Q9BU40 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRDL1Q9BU40 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRDL1Q9BU40 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRDL1Q9BU40 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRDL1Q9BU40 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRDL1Q9BU40 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRDL1Q9BU40 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRDL1Q9BU40 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRDL1Q9BU40 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRDL1Q9BU40 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRDL1Q9BU40 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRDL1Q9BU40 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRDL1Q9BU40 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRDL1Q9BU40 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRDL1Q9BU40 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRDL1Q9BU40 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRDL1Q9BU40 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRDL1Q9BU40 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRDL1Q9BU40 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRDL1Q9BU40 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRDL1Q9BU40 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRDL1Q9BU40 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CHRDL1Q9BU40 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CHRDL1Q9BU40 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CHRDL1Q9BU40 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CHRDL1Q9BU40 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CHRDL1Q9BU40 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRDL1Q9BU40 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRDL1Q9BU40 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRDL1Q9BU40 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRDL1Q9BU40 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRDL1Q9BU40 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRDL1Q9BU40 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRDL1Q9BU40 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRDL1Q9BU40 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRDL1Q9BU40 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRDL1Q9BU40 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRDL1Q9BU40 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRDL1Q9BU40 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRDL1Q9BU40 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms