Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSJ2

TUBGCP2, Gamma-tubulin complex component 2, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP2Q9BSJ2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TUBGCP2Q9BSJ2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TUBGCP2Q9BSJ2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TUBGCP2Q9BSJ2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TUBGCP2Q9BSJ2 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TUBGCP2Q9BSJ2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TUBGCP2Q9BSJ2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TUBGCP2Q9BSJ2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TUBGCP2Q9BSJ2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TUBGCP2Q9BSJ2 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TUBGCP2Q9BSJ2 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TUBGCP2Q9BSJ2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TUBGCP2Q9BSJ2 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TUBGCP2Q9BSJ2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TUBGCP2Q9BSJ2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TUBGCP2Q9BSJ2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TUBGCP2Q9BSJ2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TUBGCP2Q9BSJ2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TUBGCP2Q9BSJ2 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TUBGCP2Q9BSJ2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TUBGCP2Q9BSJ2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TUBGCP2Q9BSJ2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TUBGCP2Q9BSJ2 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TUBGCP2Q9BSJ2 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TUBGCP2Q9BSJ2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TUBGCP2Q9BSJ2 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TUBGCP2Q9BSJ2 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TUBGCP2Q9BSJ2 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TUBGCP2Q9BSJ2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TUBGCP2Q9BSJ2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TUBGCP2Q9BSJ2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TUBGCP2Q9BSJ2 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TUBGCP2Q9BSJ2 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TUBGCP2Q9BSJ2 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TUBGCP2Q9BSJ2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TUBGCP2Q9BSJ2 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TUBGCP2Q9BSJ2 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TUBGCP2Q9BSJ2 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TUBGCP2Q9BSJ2 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TUBGCP2Q9BSJ2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TUBGCP2Q9BSJ2 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TUBGCP2Q9BSJ2 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TUBGCP2Q9BSJ2 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TUBGCP2Q9BSJ2 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TUBGCP2Q9BSJ2 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TUBGCP2Q9BSJ2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TUBGCP2Q9BSJ2 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TUBGCP2Q9BSJ2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TUBGCP2Q9BSJ2 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TUBGCP2Q9BSJ2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TUBGCP2Q9BSJ2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TUBGCP2Q9BSJ2 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TUBGCP2Q9BSJ2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TUBGCP2Q9BSJ2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TUBGCP2Q9BSJ2 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TUBGCP2Q9BSJ2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TUBGCP2Q9BSJ2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TUBGCP2Q9BSJ2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TUBGCP2Q9BSJ2 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TUBGCP2Q9BSJ2 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TUBGCP2Q9BSJ2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TUBGCP2Q9BSJ2 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TUBGCP2Q9BSJ2 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TUBGCP2Q9BSJ2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TUBGCP2Q9BSJ2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TUBGCP2Q9BSJ2 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TUBGCP2Q9BSJ2 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TUBGCP2Q9BSJ2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TUBGCP2Q9BSJ2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TUBGCP2Q9BSJ2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TUBGCP2Q9BSJ2 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TUBGCP2Q9BSJ2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TUBGCP2Q9BSJ2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TUBGCP2Q9BSJ2 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TUBGCP2Q9BSJ2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TUBGCP2Q9BSJ2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TUBGCP2Q9BSJ2 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TUBGCP2Q9BSJ2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TUBGCP2Q9BSJ2 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TUBGCP2Q9BSJ2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TUBGCP2Q9BSJ2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TUBGCP2Q9BSJ2 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TUBGCP2Q9BSJ2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TUBGCP2Q9BSJ2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TUBGCP2Q9BSJ2 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TUBGCP2Q9BSJ2 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TUBGCP2Q9BSJ2 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TUBGCP2Q9BSJ2 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TUBGCP2Q9BSJ2 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TUBGCP2Q9BSJ2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TUBGCP2Q9BSJ2 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TUBGCP2Q9BSJ2 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TUBGCP2Q9BSJ2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TUBGCP2Q9BSJ2 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TUBGCP2Q9BSJ2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TUBGCP2Q9BSJ2 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TUBGCP2Q9BSJ2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TUBGCP2Q9BSJ2 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TUBGCP2Q9BSJ2 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TUBGCP2Q9BSJ2 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.2 ms