Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRS2

RIOK1, Serine/threonine-protein kinase RIO1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK1Q9BRS2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RIOK1Q9BRS2 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RIOK1Q9BRS2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RIOK1Q9BRS2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RIOK1Q9BRS2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
RIOK1Q9BRS2 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RIOK1Q9BRS2 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RIOK1Q9BRS2 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
RIOK1Q9BRS2 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RIOK1Q9BRS2 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RIOK1Q9BRS2 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RIOK1Q9BRS2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RIOK1Q9BRS2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RIOK1Q9BRS2 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RIOK1Q9BRS2 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RIOK1Q9BRS2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RIOK1Q9BRS2 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RIOK1Q9BRS2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RIOK1Q9BRS2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RIOK1Q9BRS2 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
RIOK1Q9BRS2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RIOK1Q9BRS2 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RIOK1Q9BRS2 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
RIOK1Q9BRS2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RIOK1Q9BRS2 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RIOK1Q9BRS2 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RIOK1Q9BRS2 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RIOK1Q9BRS2 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RIOK1Q9BRS2 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RIOK1Q9BRS2 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
RIOK1Q9BRS2 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
RIOK1Q9BRS2 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
RIOK1Q9BRS2 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RIOK1Q9BRS2 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RIOK1Q9BRS2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RIOK1Q9BRS2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RIOK1Q9BRS2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RIOK1Q9BRS2 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RIOK1Q9BRS2 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RIOK1Q9BRS2 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
RIOK1Q9BRS2 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RIOK1Q9BRS2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RIOK1Q9BRS2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RIOK1Q9BRS2 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RIOK1Q9BRS2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RIOK1Q9BRS2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
RIOK1Q9BRS2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RIOK1Q9BRS2 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
RIOK1Q9BRS2 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RIOK1Q9BRS2 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RIOK1Q9BRS2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RIOK1Q9BRS2 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RIOK1Q9BRS2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
RIOK1Q9BRS2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RIOK1Q9BRS2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
RIOK1Q9BRS2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
RIOK1Q9BRS2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
RIOK1Q9BRS2 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
RIOK1Q9BRS2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RIOK1Q9BRS2 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RIOK1Q9BRS2 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RIOK1Q9BRS2 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RIOK1Q9BRS2 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RIOK1Q9BRS2 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
RIOK1Q9BRS2 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
RIOK1Q9BRS2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RIOK1Q9BRS2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RIOK1Q9BRS2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RIOK1Q9BRS2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RIOK1Q9BRS2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RIOK1Q9BRS2 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RIOK1Q9BRS2 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
RIOK1Q9BRS2 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RIOK1Q9BRS2 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RIOK1Q9BRS2 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RIOK1Q9BRS2 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
RIOK1Q9BRS2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RIOK1Q9BRS2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RIOK1Q9BRS2 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RIOK1Q9BRS2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RIOK1Q9BRS2 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RIOK1Q9BRS2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
RIOK1Q9BRS2 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RIOK1Q9BRS2 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
RIOK1Q9BRS2 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
RIOK1Q9BRS2 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
RIOK1Q9BRS2 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RIOK1Q9BRS2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RIOK1Q9BRS2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RIOK1Q9BRS2 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RIOK1Q9BRS2 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RIOK1Q9BRS2 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RIOK1Q9BRS2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RIOK1Q9BRS2 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RIOK1Q9BRS2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RIOK1Q9BRS2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RIOK1Q9BRS2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
RIOK1Q9BRS2 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RIOK1Q9BRS2 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RIOK1Q9BRS2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms