Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRK5

SDF4, 45 kDa calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDF4Q9BRK5 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SDF4Q9BRK5 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SDF4Q9BRK5 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SDF4Q9BRK5 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SDF4Q9BRK5 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SDF4Q9BRK5 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SDF4Q9BRK5 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SDF4Q9BRK5 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SDF4Q9BRK5 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SDF4Q9BRK5 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SDF4Q9BRK5 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SDF4Q9BRK5 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SDF4Q9BRK5 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SDF4Q9BRK5 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SDF4Q9BRK5 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SDF4Q9BRK5 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SDF4Q9BRK5 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SDF4Q9BRK5 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SDF4Q9BRK5 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SDF4Q9BRK5 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SDF4Q9BRK5 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SDF4Q9BRK5 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SDF4Q9BRK5 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SDF4Q9BRK5 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SDF4Q9BRK5 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SDF4Q9BRK5 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SDF4Q9BRK5 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SDF4Q9BRK5 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SDF4Q9BRK5 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SDF4Q9BRK5 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SDF4Q9BRK5 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SDF4Q9BRK5 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SDF4Q9BRK5 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SDF4Q9BRK5 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SDF4Q9BRK5 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SDF4Q9BRK5 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SDF4Q9BRK5 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SDF4Q9BRK5 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SDF4Q9BRK5 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SDF4Q9BRK5 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SDF4Q9BRK5 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SDF4Q9BRK5 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SDF4Q9BRK5 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SDF4Q9BRK5 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SDF4Q9BRK5 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SDF4Q9BRK5 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SDF4Q9BRK5 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SDF4Q9BRK5 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SDF4Q9BRK5 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SDF4Q9BRK5 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SDF4Q9BRK5 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SDF4Q9BRK5 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SDF4Q9BRK5 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SDF4Q9BRK5 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SDF4Q9BRK5 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SDF4Q9BRK5 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SDF4Q9BRK5 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SDF4Q9BRK5 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SDF4Q9BRK5 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SDF4Q9BRK5 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SDF4Q9BRK5 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SDF4Q9BRK5 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SDF4Q9BRK5 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SDF4Q9BRK5 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SDF4Q9BRK5 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SDF4Q9BRK5 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SDF4Q9BRK5 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SDF4Q9BRK5 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SDF4Q9BRK5 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SDF4Q9BRK5 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SDF4Q9BRK5 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SDF4Q9BRK5 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SDF4Q9BRK5 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SDF4Q9BRK5 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SDF4Q9BRK5 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SDF4Q9BRK5 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SDF4Q9BRK5 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SDF4Q9BRK5 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SDF4Q9BRK5 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SDF4Q9BRK5 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SDF4Q9BRK5 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SDF4Q9BRK5 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SDF4Q9BRK5 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SDF4Q9BRK5 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SDF4Q9BRK5 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SDF4Q9BRK5 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SDF4Q9BRK5 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SDF4Q9BRK5 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SDF4Q9BRK5 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SDF4Q9BRK5 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SDF4Q9BRK5 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SDF4Q9BRK5 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SDF4Q9BRK5 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SDF4Q9BRK5 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SDF4Q9BRK5 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SDF4Q9BRK5 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SDF4Q9BRK5 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SDF4Q9BRK5 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SDF4Q9BRK5 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SDF4Q9BRK5 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms