Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP9

BPIFA3, BPI fold-containing family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA3Q9BQP9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BPIFA3Q9BQP9 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BPIFA3Q9BQP9 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BPIFA3Q9BQP9 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BPIFA3Q9BQP9 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BPIFA3Q9BQP9 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BPIFA3Q9BQP9 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BPIFA3Q9BQP9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BPIFA3Q9BQP9 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BPIFA3Q9BQP9 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BPIFA3Q9BQP9 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BPIFA3Q9BQP9 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BPIFA3Q9BQP9 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BPIFA3Q9BQP9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BPIFA3Q9BQP9 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BPIFA3Q9BQP9 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BPIFA3Q9BQP9 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BPIFA3Q9BQP9 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BPIFA3Q9BQP9 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BPIFA3Q9BQP9 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BPIFA3Q9BQP9 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BPIFA3Q9BQP9 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BPIFA3Q9BQP9 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BPIFA3Q9BQP9 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BPIFA3Q9BQP9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BPIFA3Q9BQP9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BPIFA3Q9BQP9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BPIFA3Q9BQP9 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BPIFA3Q9BQP9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BPIFA3Q9BQP9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BPIFA3Q9BQP9 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BPIFA3Q9BQP9 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BPIFA3Q9BQP9 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BPIFA3Q9BQP9 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BPIFA3Q9BQP9 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BPIFA3Q9BQP9 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
BPIFA3Q9BQP9 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BPIFA3Q9BQP9 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BPIFA3Q9BQP9 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BPIFA3Q9BQP9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
BPIFA3Q9BQP9 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BPIFA3Q9BQP9 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BPIFA3Q9BQP9 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BPIFA3Q9BQP9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BPIFA3Q9BQP9 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BPIFA3Q9BQP9 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BPIFA3Q9BQP9 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BPIFA3Q9BQP9 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BPIFA3Q9BQP9 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BPIFA3Q9BQP9 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BPIFA3Q9BQP9 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BPIFA3Q9BQP9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BPIFA3Q9BQP9 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BPIFA3Q9BQP9 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BPIFA3Q9BQP9 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BPIFA3Q9BQP9 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BPIFA3Q9BQP9 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BPIFA3Q9BQP9 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BPIFA3Q9BQP9 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BPIFA3Q9BQP9 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BPIFA3Q9BQP9 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BPIFA3Q9BQP9 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BPIFA3Q9BQP9 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BPIFA3Q9BQP9 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BPIFA3Q9BQP9 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BPIFA3Q9BQP9 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BPIFA3Q9BQP9 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BPIFA3Q9BQP9 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BPIFA3Q9BQP9 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BPIFA3Q9BQP9 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BPIFA3Q9BQP9 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BPIFA3Q9BQP9 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BPIFA3Q9BQP9 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BPIFA3Q9BQP9 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BPIFA3Q9BQP9 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BPIFA3Q9BQP9 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BPIFA3Q9BQP9 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BPIFA3Q9BQP9 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BPIFA3Q9BQP9 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BPIFA3Q9BQP9 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BPIFA3Q9BQP9 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BPIFA3Q9BQP9 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BPIFA3Q9BQP9 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BPIFA3Q9BQP9 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BPIFA3Q9BQP9 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BPIFA3Q9BQP9 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BPIFA3Q9BQP9 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BPIFA3Q9BQP9 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BPIFA3Q9BQP9 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BPIFA3Q9BQP9 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
BPIFA3Q9BQP9 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BPIFA3Q9BQP9 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
BPIFA3Q9BQP9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
BPIFA3Q9BQP9 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BPIFA3Q9BQP9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
BPIFA3Q9BQP9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BPIFA3Q9BQP9 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BPIFA3Q9BQP9 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BPIFA3Q9BQP9 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BPIFA3Q9BQP9 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms