Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LPIN3Q9BQK8 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LPIN3Q9BQK8 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
LPIN3Q9BQK8 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LPIN3Q9BQK8 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LPIN3Q9BQK8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LPIN3Q9BQK8 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LPIN3Q9BQK8 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
LPIN3Q9BQK8 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
LPIN3Q9BQK8 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
LPIN3Q9BQK8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LPIN3Q9BQK8 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
LPIN3Q9BQK8 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LPIN3Q9BQK8 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LPIN3Q9BQK8 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LPIN3Q9BQK8 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LPIN3Q9BQK8 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LPIN3Q9BQK8 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LPIN3Q9BQK8 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LPIN3Q9BQK8 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LPIN3Q9BQK8 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LPIN3Q9BQK8 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LPIN3Q9BQK8 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LPIN3Q9BQK8 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LPIN3Q9BQK8 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LPIN3Q9BQK8 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LPIN3Q9BQK8 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LPIN3Q9BQK8 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LPIN3Q9BQK8 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
LPIN3Q9BQK8 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LPIN3Q9BQK8 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LPIN3Q9BQK8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LPIN3Q9BQK8 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LPIN3Q9BQK8 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LPIN3Q9BQK8 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LPIN3Q9BQK8 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LPIN3Q9BQK8 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LPIN3Q9BQK8 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LPIN3Q9BQK8 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
LPIN3Q9BQK8 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LPIN3Q9BQK8 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LPIN3Q9BQK8 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LPIN3Q9BQK8 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LPIN3Q9BQK8 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LPIN3Q9BQK8 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LPIN3Q9BQK8 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LPIN3Q9BQK8 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LPIN3Q9BQK8 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LPIN3Q9BQK8 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LPIN3Q9BQK8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LPIN3Q9BQK8 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LPIN3Q9BQK8 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LPIN3Q9BQK8 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LPIN3Q9BQK8 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LPIN3Q9BQK8 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LPIN3Q9BQK8 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LPIN3Q9BQK8 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LPIN3Q9BQK8 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LPIN3Q9BQK8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LPIN3Q9BQK8 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LPIN3Q9BQK8 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LPIN3Q9BQK8 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LPIN3Q9BQK8 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LPIN3Q9BQK8 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
LPIN3Q9BQK8 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LPIN3Q9BQK8 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LPIN3Q9BQK8 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
LPIN3Q9BQK8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LPIN3Q9BQK8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LPIN3Q9BQK8 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LPIN3Q9BQK8 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LPIN3Q9BQK8 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LPIN3Q9BQK8 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LPIN3Q9BQK8 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LPIN3Q9BQK8 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LPIN3Q9BQK8 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LPIN3Q9BQK8 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LPIN3Q9BQK8 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LPIN3Q9BQK8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LPIN3Q9BQK8 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LPIN3Q9BQK8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LPIN3Q9BQK8 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LPIN3Q9BQK8 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LPIN3Q9BQK8 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
LPIN3Q9BQK8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LPIN3Q9BQK8 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LPIN3Q9BQK8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LPIN3Q9BQK8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LPIN3Q9BQK8 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LPIN3Q9BQK8 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
LPIN3Q9BQK8 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LPIN3Q9BQK8 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LPIN3Q9BQK8 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24■■□□□ 1.43
LPIN3Q9BQK8 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LPIN3Q9BQK8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LPIN3Q9BQK8 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LPIN3Q9BQK8 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LPIN3Q9BQK8 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LPIN3Q9BQK8 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LPIN3Q9BQK8 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms