Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ24

ZFYVE21, Zinc finger FYVE domain-containing protein 21, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFYVE21Q9BQ24 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZFYVE21Q9BQ24 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZFYVE21Q9BQ24 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZFYVE21Q9BQ24 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZFYVE21Q9BQ24 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZFYVE21Q9BQ24 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZFYVE21Q9BQ24 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZFYVE21Q9BQ24 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZFYVE21Q9BQ24 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZFYVE21Q9BQ24 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZFYVE21Q9BQ24 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZFYVE21Q9BQ24 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZFYVE21Q9BQ24 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZFYVE21Q9BQ24 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZFYVE21Q9BQ24 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZFYVE21Q9BQ24 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZFYVE21Q9BQ24 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZFYVE21Q9BQ24 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZFYVE21Q9BQ24 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZFYVE21Q9BQ24 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZFYVE21Q9BQ24 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZFYVE21Q9BQ24 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZFYVE21Q9BQ24 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZFYVE21Q9BQ24 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZFYVE21Q9BQ24 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZFYVE21Q9BQ24 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZFYVE21Q9BQ24 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZFYVE21Q9BQ24 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZFYVE21Q9BQ24 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZFYVE21Q9BQ24 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZFYVE21Q9BQ24 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZFYVE21Q9BQ24 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZFYVE21Q9BQ24 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZFYVE21Q9BQ24 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZFYVE21Q9BQ24 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZFYVE21Q9BQ24 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZFYVE21Q9BQ24 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZFYVE21Q9BQ24 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZFYVE21Q9BQ24 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZFYVE21Q9BQ24 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZFYVE21Q9BQ24 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZFYVE21Q9BQ24 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZFYVE21Q9BQ24 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZFYVE21Q9BQ24 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZFYVE21Q9BQ24 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZFYVE21Q9BQ24 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZFYVE21Q9BQ24 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZFYVE21Q9BQ24 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZFYVE21Q9BQ24 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZFYVE21Q9BQ24 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZFYVE21Q9BQ24 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZFYVE21Q9BQ24 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZFYVE21Q9BQ24 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZFYVE21Q9BQ24 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZFYVE21Q9BQ24 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZFYVE21Q9BQ24 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZFYVE21Q9BQ24 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZFYVE21Q9BQ24 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZFYVE21Q9BQ24 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZFYVE21Q9BQ24 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZFYVE21Q9BQ24 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZFYVE21Q9BQ24 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ZFYVE21Q9BQ24 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ZFYVE21Q9BQ24 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ZFYVE21Q9BQ24 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ZFYVE21Q9BQ24 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZFYVE21Q9BQ24 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZFYVE21Q9BQ24 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZFYVE21Q9BQ24 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZFYVE21Q9BQ24 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZFYVE21Q9BQ24 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZFYVE21Q9BQ24 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZFYVE21Q9BQ24 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZFYVE21Q9BQ24 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZFYVE21Q9BQ24 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZFYVE21Q9BQ24 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZFYVE21Q9BQ24 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZFYVE21Q9BQ24 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZFYVE21Q9BQ24 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZFYVE21Q9BQ24 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZFYVE21Q9BQ24 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZFYVE21Q9BQ24 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZFYVE21Q9BQ24 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZFYVE21Q9BQ24 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ZFYVE21Q9BQ24 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZFYVE21Q9BQ24 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZFYVE21Q9BQ24 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZFYVE21Q9BQ24 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZFYVE21Q9BQ24 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZFYVE21Q9BQ24 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZFYVE21Q9BQ24 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZFYVE21Q9BQ24 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZFYVE21Q9BQ24 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZFYVE21Q9BQ24 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZFYVE21Q9BQ24 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZFYVE21Q9BQ24 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZFYVE21Q9BQ24 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZFYVE21Q9BQ24 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZFYVE21Q9BQ24 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZFYVE21Q9BQ24 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms