Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SPOCK3Q9BQ16 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SPOCK3Q9BQ16 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SPOCK3Q9BQ16 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SPOCK3Q9BQ16 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SPOCK3Q9BQ16 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SPOCK3Q9BQ16 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SPOCK3Q9BQ16 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SPOCK3Q9BQ16 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SPOCK3Q9BQ16 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SPOCK3Q9BQ16 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SPOCK3Q9BQ16 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SPOCK3Q9BQ16 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SPOCK3Q9BQ16 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SPOCK3Q9BQ16 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SPOCK3Q9BQ16 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
SPOCK3Q9BQ16 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SPOCK3Q9BQ16 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SPOCK3Q9BQ16 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SPOCK3Q9BQ16 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SPOCK3Q9BQ16 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SPOCK3Q9BQ16 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
SPOCK3Q9BQ16 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SPOCK3Q9BQ16 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SPOCK3Q9BQ16 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SPOCK3Q9BQ16 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SPOCK3Q9BQ16 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SPOCK3Q9BQ16 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SPOCK3Q9BQ16 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
SPOCK3Q9BQ16 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
SPOCK3Q9BQ16 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
SPOCK3Q9BQ16 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SPOCK3Q9BQ16 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SPOCK3Q9BQ16 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
SPOCK3Q9BQ16 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SPOCK3Q9BQ16 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SPOCK3Q9BQ16 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SPOCK3Q9BQ16 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SPOCK3Q9BQ16 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SPOCK3Q9BQ16 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SPOCK3Q9BQ16 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SPOCK3Q9BQ16 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SPOCK3Q9BQ16 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SPOCK3Q9BQ16 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SPOCK3Q9BQ16 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SPOCK3Q9BQ16 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SPOCK3Q9BQ16 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SPOCK3Q9BQ16 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
SPOCK3Q9BQ16 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SPOCK3Q9BQ16 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SPOCK3Q9BQ16 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SPOCK3Q9BQ16 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SPOCK3Q9BQ16 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SPOCK3Q9BQ16 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SPOCK3Q9BQ16 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SPOCK3Q9BQ16 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SPOCK3Q9BQ16 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SPOCK3Q9BQ16 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SPOCK3Q9BQ16 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SPOCK3Q9BQ16 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SPOCK3Q9BQ16 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SPOCK3Q9BQ16 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SPOCK3Q9BQ16 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SPOCK3Q9BQ16 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SPOCK3Q9BQ16 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SPOCK3Q9BQ16 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SPOCK3Q9BQ16 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SPOCK3Q9BQ16 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SPOCK3Q9BQ16 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SPOCK3Q9BQ16 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SPOCK3Q9BQ16 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SPOCK3Q9BQ16 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SPOCK3Q9BQ16 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SPOCK3Q9BQ16 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SPOCK3Q9BQ16 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SPOCK3Q9BQ16 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SPOCK3Q9BQ16 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SPOCK3Q9BQ16 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SPOCK3Q9BQ16 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SPOCK3Q9BQ16 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SPOCK3Q9BQ16 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SPOCK3Q9BQ16 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SPOCK3Q9BQ16 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SPOCK3Q9BQ16 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SPOCK3Q9BQ16 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SPOCK3Q9BQ16 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SPOCK3Q9BQ16 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SPOCK3Q9BQ16 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SPOCK3Q9BQ16 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SPOCK3Q9BQ16 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SPOCK3Q9BQ16 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SPOCK3Q9BQ16 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SPOCK3Q9BQ16 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SPOCK3Q9BQ16 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SPOCK3Q9BQ16 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SPOCK3Q9BQ16 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SPOCK3Q9BQ16 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SPOCK3Q9BQ16 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SPOCK3Q9BQ16 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SPOCK3Q9BQ16 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
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