Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPY8

HOPX, Homeodomain-only protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOPXQ9BPY8 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOPXQ9BPY8 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
HOPXQ9BPY8 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
HOPXQ9BPY8 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOPXQ9BPY8 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOPXQ9BPY8 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOPXQ9BPY8 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOPXQ9BPY8 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOPXQ9BPY8 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOPXQ9BPY8 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOPXQ9BPY8 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOPXQ9BPY8 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOPXQ9BPY8 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
HOPXQ9BPY8 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOPXQ9BPY8 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOPXQ9BPY8 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
HOPXQ9BPY8 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOPXQ9BPY8 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOPXQ9BPY8 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOPXQ9BPY8 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOPXQ9BPY8 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOPXQ9BPY8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOPXQ9BPY8 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOPXQ9BPY8 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOPXQ9BPY8 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOPXQ9BPY8 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOPXQ9BPY8 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOPXQ9BPY8 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOPXQ9BPY8 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOPXQ9BPY8 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOPXQ9BPY8 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOPXQ9BPY8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOPXQ9BPY8 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOPXQ9BPY8 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOPXQ9BPY8 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOPXQ9BPY8 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOPXQ9BPY8 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
HOPXQ9BPY8 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOPXQ9BPY8 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOPXQ9BPY8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOPXQ9BPY8 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
HOPXQ9BPY8 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOPXQ9BPY8 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOPXQ9BPY8 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOPXQ9BPY8 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOPXQ9BPY8 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOPXQ9BPY8 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOPXQ9BPY8 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOPXQ9BPY8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOPXQ9BPY8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
HOPXQ9BPY8 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOPXQ9BPY8 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOPXQ9BPY8 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOPXQ9BPY8 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOPXQ9BPY8 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOPXQ9BPY8 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOPXQ9BPY8 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOPXQ9BPY8 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOPXQ9BPY8 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOPXQ9BPY8 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOPXQ9BPY8 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOPXQ9BPY8 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOPXQ9BPY8 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOPXQ9BPY8 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOPXQ9BPY8 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOPXQ9BPY8 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOPXQ9BPY8 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOPXQ9BPY8 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOPXQ9BPY8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOPXQ9BPY8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOPXQ9BPY8 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOPXQ9BPY8 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOPXQ9BPY8 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOPXQ9BPY8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOPXQ9BPY8 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOPXQ9BPY8 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOPXQ9BPY8 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOPXQ9BPY8 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOPXQ9BPY8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOPXQ9BPY8 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOPXQ9BPY8 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOPXQ9BPY8 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOPXQ9BPY8 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOPXQ9BPY8 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOPXQ9BPY8 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOPXQ9BPY8 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOPXQ9BPY8 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOPXQ9BPY8 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOPXQ9BPY8 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOPXQ9BPY8 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HOPXQ9BPY8 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOPXQ9BPY8 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOPXQ9BPY8 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOPXQ9BPY8 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOPXQ9BPY8 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOPXQ9BPY8 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOPXQ9BPY8 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOPXQ9BPY8 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOPXQ9BPY8 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOPXQ9BPY8 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms