Protein–RNA interactions for Protein: Q99956

DUSP9, Dual specificity protein phosphatase 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP9Q99956 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DUSP9Q99956 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DUSP9Q99956 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DUSP9Q99956 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DUSP9Q99956 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DUSP9Q99956 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DUSP9Q99956 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DUSP9Q99956 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DUSP9Q99956 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DUSP9Q99956 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DUSP9Q99956 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DUSP9Q99956 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DUSP9Q99956 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DUSP9Q99956 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DUSP9Q99956 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DUSP9Q99956 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DUSP9Q99956 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DUSP9Q99956 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DUSP9Q99956 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DUSP9Q99956 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DUSP9Q99956 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DUSP9Q99956 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
DUSP9Q99956 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
DUSP9Q99956 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DUSP9Q99956 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DUSP9Q99956 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DUSP9Q99956 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DUSP9Q99956 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DUSP9Q99956 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DUSP9Q99956 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DUSP9Q99956 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DUSP9Q99956 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DUSP9Q99956 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DUSP9Q99956 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DUSP9Q99956 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DUSP9Q99956 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DUSP9Q99956 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DUSP9Q99956 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DUSP9Q99956 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
DUSP9Q99956 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DUSP9Q99956 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DUSP9Q99956 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DUSP9Q99956 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DUSP9Q99956 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DUSP9Q99956 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
DUSP9Q99956 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DUSP9Q99956 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DUSP9Q99956 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DUSP9Q99956 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DUSP9Q99956 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DUSP9Q99956 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DUSP9Q99956 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DUSP9Q99956 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DUSP9Q99956 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DUSP9Q99956 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DUSP9Q99956 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DUSP9Q99956 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DUSP9Q99956 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DUSP9Q99956 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DUSP9Q99956 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DUSP9Q99956 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DUSP9Q99956 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DUSP9Q99956 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
DUSP9Q99956 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
DUSP9Q99956 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DUSP9Q99956 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DUSP9Q99956 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
DUSP9Q99956 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DUSP9Q99956 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DUSP9Q99956 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DUSP9Q99956 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DUSP9Q99956 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DUSP9Q99956 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DUSP9Q99956 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DUSP9Q99956 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DUSP9Q99956 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DUSP9Q99956 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DUSP9Q99956 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DUSP9Q99956 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DUSP9Q99956 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DUSP9Q99956 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DUSP9Q99956 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DUSP9Q99956 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DUSP9Q99956 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DUSP9Q99956 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DUSP9Q99956 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DUSP9Q99956 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DUSP9Q99956 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DUSP9Q99956 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DUSP9Q99956 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DUSP9Q99956 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DUSP9Q99956 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DUSP9Q99956 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DUSP9Q99956 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DUSP9Q99956 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DUSP9Q99956 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DUSP9Q99956 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DUSP9Q99956 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DUSP9Q99956 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DUSP9Q99956 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms