Protein–RNA interactions for Protein: Q99732

LITAF, Lipopolysaccharide-induced tumor necrosis factor-alpha factor, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LITAFQ99732 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LITAFQ99732 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LITAFQ99732 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
LITAFQ99732 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LITAFQ99732 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LITAFQ99732 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LITAFQ99732 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LITAFQ99732 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LITAFQ99732 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LITAFQ99732 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LITAFQ99732 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LITAFQ99732 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LITAFQ99732 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LITAFQ99732 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LITAFQ99732 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LITAFQ99732 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LITAFQ99732 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LITAFQ99732 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LITAFQ99732 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LITAFQ99732 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LITAFQ99732 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LITAFQ99732 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LITAFQ99732 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LITAFQ99732 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LITAFQ99732 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LITAFQ99732 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LITAFQ99732 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LITAFQ99732 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LITAFQ99732 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LITAFQ99732 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LITAFQ99732 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LITAFQ99732 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LITAFQ99732 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LITAFQ99732 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LITAFQ99732 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
LITAFQ99732 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LITAFQ99732 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LITAFQ99732 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LITAFQ99732 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LITAFQ99732 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LITAFQ99732 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LITAFQ99732 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LITAFQ99732 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LITAFQ99732 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LITAFQ99732 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LITAFQ99732 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LITAFQ99732 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LITAFQ99732 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LITAFQ99732 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LITAFQ99732 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LITAFQ99732 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LITAFQ99732 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LITAFQ99732 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LITAFQ99732 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LITAFQ99732 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LITAFQ99732 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LITAFQ99732 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LITAFQ99732 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LITAFQ99732 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LITAFQ99732 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LITAFQ99732 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
LITAFQ99732 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
LITAFQ99732 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LITAFQ99732 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LITAFQ99732 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LITAFQ99732 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
LITAFQ99732 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LITAFQ99732 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LITAFQ99732 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LITAFQ99732 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LITAFQ99732 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LITAFQ99732 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LITAFQ99732 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LITAFQ99732 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LITAFQ99732 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LITAFQ99732 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
LITAFQ99732 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LITAFQ99732 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LITAFQ99732 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LITAFQ99732 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LITAFQ99732 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LITAFQ99732 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LITAFQ99732 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LITAFQ99732 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LITAFQ99732 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LITAFQ99732 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LITAFQ99732 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LITAFQ99732 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LITAFQ99732 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LITAFQ99732 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LITAFQ99732 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LITAFQ99732 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
LITAFQ99732 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LITAFQ99732 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LITAFQ99732 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LITAFQ99732 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LITAFQ99732 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LITAFQ99732 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LITAFQ99732 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
LITAFQ99732 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms