Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RBBP8Q99708 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RBBP8Q99708 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RBBP8Q99708 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RBBP8Q99708 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RBBP8Q99708 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RBBP8Q99708 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RBBP8Q99708 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RBBP8Q99708 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RBBP8Q99708 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RBBP8Q99708 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RBBP8Q99708 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RBBP8Q99708 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RBBP8Q99708 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RBBP8Q99708 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RBBP8Q99708 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RBBP8Q99708 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RBBP8Q99708 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RBBP8Q99708 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RBBP8Q99708 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RBBP8Q99708 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RBBP8Q99708 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RBBP8Q99708 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RBBP8Q99708 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RBBP8Q99708 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RBBP8Q99708 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RBBP8Q99708 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RBBP8Q99708 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RBBP8Q99708 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RBBP8Q99708 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RBBP8Q99708 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RBBP8Q99708 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RBBP8Q99708 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RBBP8Q99708 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RBBP8Q99708 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RBBP8Q99708 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RBBP8Q99708 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RBBP8Q99708 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RBBP8Q99708 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RBBP8Q99708 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RBBP8Q99708 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RBBP8Q99708 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RBBP8Q99708 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RBBP8Q99708 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RBBP8Q99708 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RBBP8Q99708 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RBBP8Q99708 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RBBP8Q99708 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RBBP8Q99708 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RBBP8Q99708 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RBBP8Q99708 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RBBP8Q99708 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RBBP8Q99708 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RBBP8Q99708 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RBBP8Q99708 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RBBP8Q99708 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RBBP8Q99708 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RBBP8Q99708 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RBBP8Q99708 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RBBP8Q99708 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RBBP8Q99708 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RBBP8Q99708 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RBBP8Q99708 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RBBP8Q99708 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RBBP8Q99708 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RBBP8Q99708 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RBBP8Q99708 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RBBP8Q99708 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RBBP8Q99708 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RBBP8Q99708 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RBBP8Q99708 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RBBP8Q99708 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RBBP8Q99708 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RBBP8Q99708 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RBBP8Q99708 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RBBP8Q99708 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBBP8Q99708 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBBP8Q99708 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBBP8Q99708 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBBP8Q99708 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBBP8Q99708 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBBP8Q99708 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBBP8Q99708 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBBP8Q99708 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RBBP8Q99708 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RBBP8Q99708 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RBBP8Q99708 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RBBP8Q99708 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RBBP8Q99708 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RBBP8Q99708 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RBBP8Q99708 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RBBP8Q99708 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RBBP8Q99708 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RBBP8Q99708 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RBBP8Q99708 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RBBP8Q99708 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RBBP8Q99708 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RBBP8Q99708 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RBBP8Q99708 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RBBP8Q99708 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms