Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VAT1Q99536 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VAT1Q99536 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VAT1Q99536 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
VAT1Q99536 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VAT1Q99536 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VAT1Q99536 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VAT1Q99536 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VAT1Q99536 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
VAT1Q99536 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VAT1Q99536 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VAT1Q99536 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VAT1Q99536 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VAT1Q99536 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VAT1Q99536 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VAT1Q99536 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VAT1Q99536 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VAT1Q99536 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VAT1Q99536 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VAT1Q99536 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
VAT1Q99536 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VAT1Q99536 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VAT1Q99536 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VAT1Q99536 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
VAT1Q99536 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VAT1Q99536 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
VAT1Q99536 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VAT1Q99536 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VAT1Q99536 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VAT1Q99536 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VAT1Q99536 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VAT1Q99536 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VAT1Q99536 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VAT1Q99536 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VAT1Q99536 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VAT1Q99536 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VAT1Q99536 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VAT1Q99536 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VAT1Q99536 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VAT1Q99536 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VAT1Q99536 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VAT1Q99536 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VAT1Q99536 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VAT1Q99536 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VAT1Q99536 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VAT1Q99536 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
VAT1Q99536 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VAT1Q99536 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VAT1Q99536 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VAT1Q99536 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VAT1Q99536 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VAT1Q99536 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VAT1Q99536 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VAT1Q99536 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VAT1Q99536 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VAT1Q99536 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VAT1Q99536 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VAT1Q99536 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VAT1Q99536 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VAT1Q99536 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VAT1Q99536 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VAT1Q99536 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VAT1Q99536 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VAT1Q99536 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VAT1Q99536 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VAT1Q99536 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VAT1Q99536 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
VAT1Q99536 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VAT1Q99536 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VAT1Q99536 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
VAT1Q99536 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VAT1Q99536 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VAT1Q99536 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VAT1Q99536 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VAT1Q99536 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VAT1Q99536 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VAT1Q99536 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VAT1Q99536 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VAT1Q99536 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VAT1Q99536 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VAT1Q99536 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VAT1Q99536 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VAT1Q99536 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
VAT1Q99536 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VAT1Q99536 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VAT1Q99536 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VAT1Q99536 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VAT1Q99536 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VAT1Q99536 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VAT1Q99536 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VAT1Q99536 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VAT1Q99536 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
VAT1Q99536 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VAT1Q99536 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VAT1Q99536 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VAT1Q99536 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VAT1Q99536 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VAT1Q99536 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VAT1Q99536 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VAT1Q99536 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms