Protein–RNA interactions for Protein: Q99457

NAP1L3, Nucleosome assembly protein 1-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAP1L3Q99457 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NAP1L3Q99457 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NAP1L3Q99457 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NAP1L3Q99457 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NAP1L3Q99457 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NAP1L3Q99457 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NAP1L3Q99457 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NAP1L3Q99457 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NAP1L3Q99457 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NAP1L3Q99457 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NAP1L3Q99457 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NAP1L3Q99457 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NAP1L3Q99457 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NAP1L3Q99457 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NAP1L3Q99457 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NAP1L3Q99457 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NAP1L3Q99457 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NAP1L3Q99457 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NAP1L3Q99457 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NAP1L3Q99457 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NAP1L3Q99457 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
NAP1L3Q99457 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NAP1L3Q99457 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NAP1L3Q99457 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NAP1L3Q99457 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NAP1L3Q99457 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NAP1L3Q99457 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NAP1L3Q99457 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NAP1L3Q99457 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NAP1L3Q99457 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NAP1L3Q99457 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NAP1L3Q99457 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NAP1L3Q99457 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NAP1L3Q99457 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NAP1L3Q99457 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NAP1L3Q99457 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NAP1L3Q99457 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NAP1L3Q99457 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NAP1L3Q99457 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NAP1L3Q99457 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NAP1L3Q99457 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NAP1L3Q99457 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NAP1L3Q99457 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NAP1L3Q99457 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NAP1L3Q99457 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NAP1L3Q99457 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NAP1L3Q99457 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NAP1L3Q99457 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
NAP1L3Q99457 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NAP1L3Q99457 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
NAP1L3Q99457 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NAP1L3Q99457 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NAP1L3Q99457 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NAP1L3Q99457 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NAP1L3Q99457 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NAP1L3Q99457 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NAP1L3Q99457 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NAP1L3Q99457 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NAP1L3Q99457 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NAP1L3Q99457 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NAP1L3Q99457 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NAP1L3Q99457 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NAP1L3Q99457 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NAP1L3Q99457 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NAP1L3Q99457 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NAP1L3Q99457 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NAP1L3Q99457 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NAP1L3Q99457 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NAP1L3Q99457 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NAP1L3Q99457 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NAP1L3Q99457 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NAP1L3Q99457 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NAP1L3Q99457 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NAP1L3Q99457 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NAP1L3Q99457 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NAP1L3Q99457 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NAP1L3Q99457 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NAP1L3Q99457 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NAP1L3Q99457 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NAP1L3Q99457 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NAP1L3Q99457 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NAP1L3Q99457 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NAP1L3Q99457 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NAP1L3Q99457 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NAP1L3Q99457 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NAP1L3Q99457 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NAP1L3Q99457 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NAP1L3Q99457 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NAP1L3Q99457 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NAP1L3Q99457 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NAP1L3Q99457 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NAP1L3Q99457 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NAP1L3Q99457 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NAP1L3Q99457 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NAP1L3Q99457 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NAP1L3Q99457 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NAP1L3Q99457 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NAP1L3Q99457 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NAP1L3Q99457 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NAP1L3Q99457 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms