Protein–RNA interactions for Protein: Q99453

PHOX2B, Paired mesoderm homeobox protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2BQ99453 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHOX2BQ99453 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHOX2BQ99453 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHOX2BQ99453 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHOX2BQ99453 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHOX2BQ99453 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHOX2BQ99453 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHOX2BQ99453 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PHOX2BQ99453 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHOX2BQ99453 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PHOX2BQ99453 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHOX2BQ99453 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PHOX2BQ99453 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHOX2BQ99453 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHOX2BQ99453 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHOX2BQ99453 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHOX2BQ99453 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PHOX2BQ99453 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHOX2BQ99453 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHOX2BQ99453 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHOX2BQ99453 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHOX2BQ99453 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHOX2BQ99453 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHOX2BQ99453 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PHOX2BQ99453 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PHOX2BQ99453 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PHOX2BQ99453 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PHOX2BQ99453 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PHOX2BQ99453 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PHOX2BQ99453 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PHOX2BQ99453 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PHOX2BQ99453 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PHOX2BQ99453 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PHOX2BQ99453 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PHOX2BQ99453 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PHOX2BQ99453 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PHOX2BQ99453 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PHOX2BQ99453 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PHOX2BQ99453 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PHOX2BQ99453 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PHOX2BQ99453 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHOX2BQ99453 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHOX2BQ99453 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHOX2BQ99453 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHOX2BQ99453 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PHOX2BQ99453 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHOX2BQ99453 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHOX2BQ99453 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHOX2BQ99453 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PHOX2BQ99453 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PHOX2BQ99453 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHOX2BQ99453 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHOX2BQ99453 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHOX2BQ99453 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHOX2BQ99453 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHOX2BQ99453 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHOX2BQ99453 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHOX2BQ99453 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHOX2BQ99453 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHOX2BQ99453 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHOX2BQ99453 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHOX2BQ99453 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHOX2BQ99453 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHOX2BQ99453 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PHOX2BQ99453 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHOX2BQ99453 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHOX2BQ99453 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHOX2BQ99453 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHOX2BQ99453 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHOX2BQ99453 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHOX2BQ99453 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHOX2BQ99453 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHOX2BQ99453 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHOX2BQ99453 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHOX2BQ99453 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PHOX2BQ99453 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHOX2BQ99453 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHOX2BQ99453 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHOX2BQ99453 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHOX2BQ99453 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHOX2BQ99453 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHOX2BQ99453 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHOX2BQ99453 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHOX2BQ99453 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHOX2BQ99453 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHOX2BQ99453 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHOX2BQ99453 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PHOX2BQ99453 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PHOX2BQ99453 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PHOX2BQ99453 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PHOX2BQ99453 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PHOX2BQ99453 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PHOX2BQ99453 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHOX2BQ99453 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHOX2BQ99453 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHOX2BQ99453 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHOX2BQ99453 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHOX2BQ99453 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PHOX2BQ99453 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHOX2BQ99453 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms