Protein–RNA interactions for Protein: Q96SJ8

TSPAN18, Tetraspanin-18, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN18Q96SJ8 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TSPAN18Q96SJ8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSPAN18Q96SJ8 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSPAN18Q96SJ8 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSPAN18Q96SJ8 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSPAN18Q96SJ8 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSPAN18Q96SJ8 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TSPAN18Q96SJ8 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSPAN18Q96SJ8 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSPAN18Q96SJ8 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSPAN18Q96SJ8 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSPAN18Q96SJ8 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSPAN18Q96SJ8 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSPAN18Q96SJ8 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TSPAN18Q96SJ8 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSPAN18Q96SJ8 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSPAN18Q96SJ8 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSPAN18Q96SJ8 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSPAN18Q96SJ8 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSPAN18Q96SJ8 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TSPAN18Q96SJ8 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TSPAN18Q96SJ8 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSPAN18Q96SJ8 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TSPAN18Q96SJ8 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSPAN18Q96SJ8 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSPAN18Q96SJ8 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSPAN18Q96SJ8 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSPAN18Q96SJ8 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSPAN18Q96SJ8 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSPAN18Q96SJ8 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TSPAN18Q96SJ8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSPAN18Q96SJ8 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSPAN18Q96SJ8 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSPAN18Q96SJ8 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSPAN18Q96SJ8 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSPAN18Q96SJ8 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TSPAN18Q96SJ8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSPAN18Q96SJ8 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSPAN18Q96SJ8 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSPAN18Q96SJ8 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSPAN18Q96SJ8 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSPAN18Q96SJ8 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSPAN18Q96SJ8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSPAN18Q96SJ8 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSPAN18Q96SJ8 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSPAN18Q96SJ8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSPAN18Q96SJ8 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSPAN18Q96SJ8 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TSPAN18Q96SJ8 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSPAN18Q96SJ8 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSPAN18Q96SJ8 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TSPAN18Q96SJ8 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSPAN18Q96SJ8 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSPAN18Q96SJ8 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TSPAN18Q96SJ8 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSPAN18Q96SJ8 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSPAN18Q96SJ8 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSPAN18Q96SJ8 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSPAN18Q96SJ8 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSPAN18Q96SJ8 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSPAN18Q96SJ8 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSPAN18Q96SJ8 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TSPAN18Q96SJ8 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSPAN18Q96SJ8 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TSPAN18Q96SJ8 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSPAN18Q96SJ8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSPAN18Q96SJ8 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSPAN18Q96SJ8 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSPAN18Q96SJ8 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TSPAN18Q96SJ8 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSPAN18Q96SJ8 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSPAN18Q96SJ8 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSPAN18Q96SJ8 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSPAN18Q96SJ8 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSPAN18Q96SJ8 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSPAN18Q96SJ8 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSPAN18Q96SJ8 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSPAN18Q96SJ8 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSPAN18Q96SJ8 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSPAN18Q96SJ8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSPAN18Q96SJ8 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSPAN18Q96SJ8 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSPAN18Q96SJ8 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSPAN18Q96SJ8 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TSPAN18Q96SJ8 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSPAN18Q96SJ8 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSPAN18Q96SJ8 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSPAN18Q96SJ8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSPAN18Q96SJ8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSPAN18Q96SJ8 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSPAN18Q96SJ8 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSPAN18Q96SJ8 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSPAN18Q96SJ8 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSPAN18Q96SJ8 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSPAN18Q96SJ8 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSPAN18Q96SJ8 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSPAN18Q96SJ8 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TSPAN18Q96SJ8 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TSPAN18Q96SJ8 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSPAN18Q96SJ8 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms