Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK1

CITED4, Cbp/p300-interacting transactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED4Q96RK1 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CITED4Q96RK1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CITED4Q96RK1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CITED4Q96RK1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CITED4Q96RK1 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CITED4Q96RK1 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CITED4Q96RK1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CITED4Q96RK1 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CITED4Q96RK1 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CITED4Q96RK1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CITED4Q96RK1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CITED4Q96RK1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CITED4Q96RK1 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CITED4Q96RK1 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CITED4Q96RK1 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CITED4Q96RK1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CITED4Q96RK1 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CITED4Q96RK1 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CITED4Q96RK1 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CITED4Q96RK1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CITED4Q96RK1 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CITED4Q96RK1 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CITED4Q96RK1 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CITED4Q96RK1 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CITED4Q96RK1 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CITED4Q96RK1 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CITED4Q96RK1 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CITED4Q96RK1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CITED4Q96RK1 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CITED4Q96RK1 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CITED4Q96RK1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CITED4Q96RK1 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CITED4Q96RK1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CITED4Q96RK1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CITED4Q96RK1 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CITED4Q96RK1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CITED4Q96RK1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CITED4Q96RK1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CITED4Q96RK1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CITED4Q96RK1 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CITED4Q96RK1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CITED4Q96RK1 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CITED4Q96RK1 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CITED4Q96RK1 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CITED4Q96RK1 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CITED4Q96RK1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CITED4Q96RK1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CITED4Q96RK1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CITED4Q96RK1 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CITED4Q96RK1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CITED4Q96RK1 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CITED4Q96RK1 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CITED4Q96RK1 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CITED4Q96RK1 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CITED4Q96RK1 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CITED4Q96RK1 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CITED4Q96RK1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CITED4Q96RK1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CITED4Q96RK1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CITED4Q96RK1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CITED4Q96RK1 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CITED4Q96RK1 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CITED4Q96RK1 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CITED4Q96RK1 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CITED4Q96RK1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CITED4Q96RK1 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CITED4Q96RK1 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CITED4Q96RK1 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CITED4Q96RK1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CITED4Q96RK1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CITED4Q96RK1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CITED4Q96RK1 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CITED4Q96RK1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CITED4Q96RK1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CITED4Q96RK1 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CITED4Q96RK1 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CITED4Q96RK1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CITED4Q96RK1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CITED4Q96RK1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CITED4Q96RK1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CITED4Q96RK1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CITED4Q96RK1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CITED4Q96RK1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CITED4Q96RK1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CITED4Q96RK1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CITED4Q96RK1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CITED4Q96RK1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CITED4Q96RK1 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CITED4Q96RK1 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CITED4Q96RK1 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CITED4Q96RK1 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CITED4Q96RK1 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CITED4Q96RK1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CITED4Q96RK1 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CITED4Q96RK1 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CITED4Q96RK1 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CITED4Q96RK1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CITED4Q96RK1 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CITED4Q96RK1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CITED4Q96RK1 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms