Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF7

GCNA, Acidic repeat-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNAQ96QF7 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GCNAQ96QF7 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GCNAQ96QF7 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GCNAQ96QF7 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GCNAQ96QF7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GCNAQ96QF7 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GCNAQ96QF7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
GCNAQ96QF7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GCNAQ96QF7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GCNAQ96QF7 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GCNAQ96QF7 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GCNAQ96QF7 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
GCNAQ96QF7 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GCNAQ96QF7 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
GCNAQ96QF7 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
GCNAQ96QF7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GCNAQ96QF7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GCNAQ96QF7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GCNAQ96QF7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GCNAQ96QF7 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GCNAQ96QF7 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GCNAQ96QF7 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GCNAQ96QF7 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
GCNAQ96QF7 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GCNAQ96QF7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GCNAQ96QF7 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GCNAQ96QF7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GCNAQ96QF7 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GCNAQ96QF7 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
GCNAQ96QF7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GCNAQ96QF7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GCNAQ96QF7 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GCNAQ96QF7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GCNAQ96QF7 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
GCNAQ96QF7 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
GCNAQ96QF7 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GCNAQ96QF7 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GCNAQ96QF7 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GCNAQ96QF7 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GCNAQ96QF7 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GCNAQ96QF7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GCNAQ96QF7 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GCNAQ96QF7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GCNAQ96QF7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GCNAQ96QF7 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GCNAQ96QF7 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GCNAQ96QF7 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GCNAQ96QF7 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GCNAQ96QF7 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GCNAQ96QF7 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GCNAQ96QF7 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GCNAQ96QF7 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GCNAQ96QF7 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GCNAQ96QF7 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GCNAQ96QF7 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GCNAQ96QF7 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GCNAQ96QF7 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GCNAQ96QF7 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GCNAQ96QF7 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GCNAQ96QF7 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
GCNAQ96QF7 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GCNAQ96QF7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GCNAQ96QF7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GCNAQ96QF7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GCNAQ96QF7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GCNAQ96QF7 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GCNAQ96QF7 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GCNAQ96QF7 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GCNAQ96QF7 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GCNAQ96QF7 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GCNAQ96QF7 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GCNAQ96QF7 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GCNAQ96QF7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GCNAQ96QF7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GCNAQ96QF7 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GCNAQ96QF7 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GCNAQ96QF7 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GCNAQ96QF7 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GCNAQ96QF7 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GCNAQ96QF7 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GCNAQ96QF7 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GCNAQ96QF7 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GCNAQ96QF7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GCNAQ96QF7 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GCNAQ96QF7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GCNAQ96QF7 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GCNAQ96QF7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GCNAQ96QF7 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GCNAQ96QF7 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GCNAQ96QF7 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GCNAQ96QF7 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
GCNAQ96QF7 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GCNAQ96QF7 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GCNAQ96QF7 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GCNAQ96QF7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GCNAQ96QF7 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GCNAQ96QF7 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
GCNAQ96QF7 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GCNAQ96QF7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GCNAQ96QF7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms