Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE6

ZIM3, Zinc finger imprinted 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIM3Q96PE6 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZIM3Q96PE6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZIM3Q96PE6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZIM3Q96PE6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZIM3Q96PE6 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZIM3Q96PE6 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZIM3Q96PE6 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZIM3Q96PE6 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZIM3Q96PE6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZIM3Q96PE6 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZIM3Q96PE6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZIM3Q96PE6 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZIM3Q96PE6 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZIM3Q96PE6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ZIM3Q96PE6 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZIM3Q96PE6 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZIM3Q96PE6 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ZIM3Q96PE6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZIM3Q96PE6 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZIM3Q96PE6 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZIM3Q96PE6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZIM3Q96PE6 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZIM3Q96PE6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZIM3Q96PE6 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZIM3Q96PE6 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZIM3Q96PE6 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZIM3Q96PE6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZIM3Q96PE6 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZIM3Q96PE6 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZIM3Q96PE6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZIM3Q96PE6 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZIM3Q96PE6 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZIM3Q96PE6 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZIM3Q96PE6 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZIM3Q96PE6 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZIM3Q96PE6 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZIM3Q96PE6 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZIM3Q96PE6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ZIM3Q96PE6 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ZIM3Q96PE6 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZIM3Q96PE6 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZIM3Q96PE6 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZIM3Q96PE6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZIM3Q96PE6 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZIM3Q96PE6 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZIM3Q96PE6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZIM3Q96PE6 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZIM3Q96PE6 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZIM3Q96PE6 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZIM3Q96PE6 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ZIM3Q96PE6 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ZIM3Q96PE6 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZIM3Q96PE6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZIM3Q96PE6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZIM3Q96PE6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ZIM3Q96PE6 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZIM3Q96PE6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZIM3Q96PE6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZIM3Q96PE6 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZIM3Q96PE6 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZIM3Q96PE6 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZIM3Q96PE6 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZIM3Q96PE6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZIM3Q96PE6 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZIM3Q96PE6 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ZIM3Q96PE6 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZIM3Q96PE6 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZIM3Q96PE6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZIM3Q96PE6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZIM3Q96PE6 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZIM3Q96PE6 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZIM3Q96PE6 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZIM3Q96PE6 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZIM3Q96PE6 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZIM3Q96PE6 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZIM3Q96PE6 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZIM3Q96PE6 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZIM3Q96PE6 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZIM3Q96PE6 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZIM3Q96PE6 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZIM3Q96PE6 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ZIM3Q96PE6 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZIM3Q96PE6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZIM3Q96PE6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZIM3Q96PE6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZIM3Q96PE6 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZIM3Q96PE6 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZIM3Q96PE6 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZIM3Q96PE6 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZIM3Q96PE6 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZIM3Q96PE6 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZIM3Q96PE6 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZIM3Q96PE6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZIM3Q96PE6 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZIM3Q96PE6 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZIM3Q96PE6 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZIM3Q96PE6 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZIM3Q96PE6 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZIM3Q96PE6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZIM3Q96PE6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms