Protein–RNA interactions for Protein: Q96NY7

CLIC6, Chloride intracellular channel protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIC6Q96NY7 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLIC6Q96NY7 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLIC6Q96NY7 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLIC6Q96NY7 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLIC6Q96NY7 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLIC6Q96NY7 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CLIC6Q96NY7 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CLIC6Q96NY7 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CLIC6Q96NY7 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CLIC6Q96NY7 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CLIC6Q96NY7 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CLIC6Q96NY7 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CLIC6Q96NY7 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CLIC6Q96NY7 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CLIC6Q96NY7 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CLIC6Q96NY7 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CLIC6Q96NY7 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLIC6Q96NY7 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLIC6Q96NY7 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLIC6Q96NY7 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLIC6Q96NY7 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLIC6Q96NY7 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLIC6Q96NY7 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLIC6Q96NY7 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLIC6Q96NY7 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CLIC6Q96NY7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CLIC6Q96NY7 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CLIC6Q96NY7 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CLIC6Q96NY7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CLIC6Q96NY7 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CLIC6Q96NY7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CLIC6Q96NY7 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CLIC6Q96NY7 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CLIC6Q96NY7 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CLIC6Q96NY7 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CLIC6Q96NY7 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CLIC6Q96NY7 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLIC6Q96NY7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLIC6Q96NY7 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLIC6Q96NY7 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLIC6Q96NY7 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLIC6Q96NY7 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLIC6Q96NY7 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLIC6Q96NY7 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLIC6Q96NY7 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLIC6Q96NY7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLIC6Q96NY7 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLIC6Q96NY7 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLIC6Q96NY7 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLIC6Q96NY7 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLIC6Q96NY7 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLIC6Q96NY7 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLIC6Q96NY7 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CLIC6Q96NY7 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLIC6Q96NY7 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLIC6Q96NY7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLIC6Q96NY7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLIC6Q96NY7 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLIC6Q96NY7 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CLIC6Q96NY7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLIC6Q96NY7 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLIC6Q96NY7 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLIC6Q96NY7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLIC6Q96NY7 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLIC6Q96NY7 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLIC6Q96NY7 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLIC6Q96NY7 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLIC6Q96NY7 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLIC6Q96NY7 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLIC6Q96NY7 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLIC6Q96NY7 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLIC6Q96NY7 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLIC6Q96NY7 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLIC6Q96NY7 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLIC6Q96NY7 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLIC6Q96NY7 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CLIC6Q96NY7 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CLIC6Q96NY7 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CLIC6Q96NY7 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CLIC6Q96NY7 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CLIC6Q96NY7 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CLIC6Q96NY7 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CLIC6Q96NY7 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CLIC6Q96NY7 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CLIC6Q96NY7 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CLIC6Q96NY7 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CLIC6Q96NY7 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CLIC6Q96NY7 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CLIC6Q96NY7 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CLIC6Q96NY7 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLIC6Q96NY7 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLIC6Q96NY7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLIC6Q96NY7 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLIC6Q96NY7 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLIC6Q96NY7 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLIC6Q96NY7 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLIC6Q96NY7 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLIC6Q96NY7 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLIC6Q96NY7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLIC6Q96NY7 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms