Protein–RNA interactions for Protein: Q96MP5

ZSWIM3, Zinc finger SWIM domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 696 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZSWIM3Q96MP5 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZSWIM3Q96MP5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZSWIM3Q96MP5 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZSWIM3Q96MP5 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ZSWIM3Q96MP5 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZSWIM3Q96MP5 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZSWIM3Q96MP5 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZSWIM3Q96MP5 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZSWIM3Q96MP5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ZSWIM3Q96MP5 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZSWIM3Q96MP5 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZSWIM3Q96MP5 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZSWIM3Q96MP5 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZSWIM3Q96MP5 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZSWIM3Q96MP5 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZSWIM3Q96MP5 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZSWIM3Q96MP5 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZSWIM3Q96MP5 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZSWIM3Q96MP5 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZSWIM3Q96MP5 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZSWIM3Q96MP5 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZSWIM3Q96MP5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZSWIM3Q96MP5 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZSWIM3Q96MP5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZSWIM3Q96MP5 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZSWIM3Q96MP5 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZSWIM3Q96MP5 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZSWIM3Q96MP5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZSWIM3Q96MP5 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZSWIM3Q96MP5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ZSWIM3Q96MP5 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZSWIM3Q96MP5 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZSWIM3Q96MP5 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZSWIM3Q96MP5 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZSWIM3Q96MP5 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZSWIM3Q96MP5 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZSWIM3Q96MP5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZSWIM3Q96MP5 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZSWIM3Q96MP5 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZSWIM3Q96MP5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZSWIM3Q96MP5 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZSWIM3Q96MP5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZSWIM3Q96MP5 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZSWIM3Q96MP5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZSWIM3Q96MP5 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZSWIM3Q96MP5 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZSWIM3Q96MP5 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZSWIM3Q96MP5 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZSWIM3Q96MP5 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZSWIM3Q96MP5 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZSWIM3Q96MP5 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZSWIM3Q96MP5 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ZSWIM3Q96MP5 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZSWIM3Q96MP5 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ZSWIM3Q96MP5 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZSWIM3Q96MP5 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ZSWIM3Q96MP5 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZSWIM3Q96MP5 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZSWIM3Q96MP5 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZSWIM3Q96MP5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZSWIM3Q96MP5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZSWIM3Q96MP5 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZSWIM3Q96MP5 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZSWIM3Q96MP5 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZSWIM3Q96MP5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZSWIM3Q96MP5 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZSWIM3Q96MP5 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZSWIM3Q96MP5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZSWIM3Q96MP5 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZSWIM3Q96MP5 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZSWIM3Q96MP5 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZSWIM3Q96MP5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZSWIM3Q96MP5 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZSWIM3Q96MP5 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZSWIM3Q96MP5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZSWIM3Q96MP5 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZSWIM3Q96MP5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZSWIM3Q96MP5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZSWIM3Q96MP5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZSWIM3Q96MP5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZSWIM3Q96MP5 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZSWIM3Q96MP5 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZSWIM3Q96MP5 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZSWIM3Q96MP5 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZSWIM3Q96MP5 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZSWIM3Q96MP5 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZSWIM3Q96MP5 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZSWIM3Q96MP5 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZSWIM3Q96MP5 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZSWIM3Q96MP5 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZSWIM3Q96MP5 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZSWIM3Q96MP5 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZSWIM3Q96MP5 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZSWIM3Q96MP5 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZSWIM3Q96MP5 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ZSWIM3Q96MP5 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZSWIM3Q96MP5 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZSWIM3Q96MP5 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZSWIM3Q96MP5 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZSWIM3Q96MP5 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms