Protein–RNA interactions for Protein: Q96M02

C10orf90, Centrosomal protein C10orf90, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf90Q96M02 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C10orf90Q96M02 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C10orf90Q96M02 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C10orf90Q96M02 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C10orf90Q96M02 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C10orf90Q96M02 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C10orf90Q96M02 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C10orf90Q96M02 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C10orf90Q96M02 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C10orf90Q96M02 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
C10orf90Q96M02 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C10orf90Q96M02 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C10orf90Q96M02 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C10orf90Q96M02 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C10orf90Q96M02 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C10orf90Q96M02 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C10orf90Q96M02 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C10orf90Q96M02 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C10orf90Q96M02 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C10orf90Q96M02 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C10orf90Q96M02 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C10orf90Q96M02 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C10orf90Q96M02 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C10orf90Q96M02 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C10orf90Q96M02 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
C10orf90Q96M02 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C10orf90Q96M02 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C10orf90Q96M02 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C10orf90Q96M02 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C10orf90Q96M02 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C10orf90Q96M02 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C10orf90Q96M02 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C10orf90Q96M02 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C10orf90Q96M02 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C10orf90Q96M02 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C10orf90Q96M02 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C10orf90Q96M02 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C10orf90Q96M02 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C10orf90Q96M02 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C10orf90Q96M02 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C10orf90Q96M02 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C10orf90Q96M02 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C10orf90Q96M02 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C10orf90Q96M02 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C10orf90Q96M02 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C10orf90Q96M02 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C10orf90Q96M02 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C10orf90Q96M02 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C10orf90Q96M02 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C10orf90Q96M02 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
C10orf90Q96M02 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C10orf90Q96M02 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C10orf90Q96M02 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C10orf90Q96M02 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C10orf90Q96M02 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C10orf90Q96M02 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C10orf90Q96M02 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C10orf90Q96M02 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C10orf90Q96M02 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C10orf90Q96M02 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C10orf90Q96M02 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C10orf90Q96M02 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C10orf90Q96M02 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C10orf90Q96M02 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C10orf90Q96M02 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C10orf90Q96M02 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C10orf90Q96M02 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C10orf90Q96M02 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C10orf90Q96M02 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C10orf90Q96M02 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C10orf90Q96M02 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C10orf90Q96M02 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C10orf90Q96M02 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
C10orf90Q96M02 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C10orf90Q96M02 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C10orf90Q96M02 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C10orf90Q96M02 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C10orf90Q96M02 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C10orf90Q96M02 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C10orf90Q96M02 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C10orf90Q96M02 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C10orf90Q96M02 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C10orf90Q96M02 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C10orf90Q96M02 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C10orf90Q96M02 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C10orf90Q96M02 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C10orf90Q96M02 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C10orf90Q96M02 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
C10orf90Q96M02 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
C10orf90Q96M02 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C10orf90Q96M02 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C10orf90Q96M02 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C10orf90Q96M02 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C10orf90Q96M02 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C10orf90Q96M02 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C10orf90Q96M02 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C10orf90Q96M02 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C10orf90Q96M02 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C10orf90Q96M02 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C10orf90Q96M02 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms