Protein–RNA interactions for Protein: Q96LZ7

RMDN2, Regulator of microtubule dynamics protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RMDN2Q96LZ7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RMDN2Q96LZ7 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RMDN2Q96LZ7 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RMDN2Q96LZ7 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RMDN2Q96LZ7 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RMDN2Q96LZ7 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RMDN2Q96LZ7 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RMDN2Q96LZ7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RMDN2Q96LZ7 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RMDN2Q96LZ7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RMDN2Q96LZ7 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RMDN2Q96LZ7 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RMDN2Q96LZ7 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RMDN2Q96LZ7 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RMDN2Q96LZ7 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RMDN2Q96LZ7 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RMDN2Q96LZ7 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RMDN2Q96LZ7 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RMDN2Q96LZ7 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RMDN2Q96LZ7 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RMDN2Q96LZ7 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RMDN2Q96LZ7 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RMDN2Q96LZ7 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RMDN2Q96LZ7 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RMDN2Q96LZ7 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RMDN2Q96LZ7 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RMDN2Q96LZ7 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RMDN2Q96LZ7 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RMDN2Q96LZ7 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RMDN2Q96LZ7 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
RMDN2Q96LZ7 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RMDN2Q96LZ7 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RMDN2Q96LZ7 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RMDN2Q96LZ7 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RMDN2Q96LZ7 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RMDN2Q96LZ7 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RMDN2Q96LZ7 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RMDN2Q96LZ7 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RMDN2Q96LZ7 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RMDN2Q96LZ7 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RMDN2Q96LZ7 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RMDN2Q96LZ7 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RMDN2Q96LZ7 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RMDN2Q96LZ7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RMDN2Q96LZ7 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RMDN2Q96LZ7 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RMDN2Q96LZ7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RMDN2Q96LZ7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RMDN2Q96LZ7 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RMDN2Q96LZ7 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RMDN2Q96LZ7 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RMDN2Q96LZ7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RMDN2Q96LZ7 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RMDN2Q96LZ7 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RMDN2Q96LZ7 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RMDN2Q96LZ7 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RMDN2Q96LZ7 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RMDN2Q96LZ7 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RMDN2Q96LZ7 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RMDN2Q96LZ7 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RMDN2Q96LZ7 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RMDN2Q96LZ7 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RMDN2Q96LZ7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RMDN2Q96LZ7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RMDN2Q96LZ7 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RMDN2Q96LZ7 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RMDN2Q96LZ7 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RMDN2Q96LZ7 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RMDN2Q96LZ7 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RMDN2Q96LZ7 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RMDN2Q96LZ7 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RMDN2Q96LZ7 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RMDN2Q96LZ7 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RMDN2Q96LZ7 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RMDN2Q96LZ7 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RMDN2Q96LZ7 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RMDN2Q96LZ7 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RMDN2Q96LZ7 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RMDN2Q96LZ7 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RMDN2Q96LZ7 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RMDN2Q96LZ7 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RMDN2Q96LZ7 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RMDN2Q96LZ7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RMDN2Q96LZ7 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RMDN2Q96LZ7 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RMDN2Q96LZ7 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RMDN2Q96LZ7 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RMDN2Q96LZ7 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RMDN2Q96LZ7 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RMDN2Q96LZ7 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RMDN2Q96LZ7 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RMDN2Q96LZ7 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RMDN2Q96LZ7 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RMDN2Q96LZ7 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RMDN2Q96LZ7 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RMDN2Q96LZ7 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RMDN2Q96LZ7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RMDN2Q96LZ7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RMDN2Q96LZ7 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RMDN2Q96LZ7 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms