Protein–RNA interactions for Protein: Q96LY2

CCDC74B, Coiled-coil domain-containing protein 74B, humanhuman

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC74BQ96LY2 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC74BQ96LY2 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC74BQ96LY2 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC74BQ96LY2 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC74BQ96LY2 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC74BQ96LY2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC74BQ96LY2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC74BQ96LY2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC74BQ96LY2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC74BQ96LY2 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC74BQ96LY2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC74BQ96LY2 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC74BQ96LY2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC74BQ96LY2 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC74BQ96LY2 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC74BQ96LY2 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC74BQ96LY2 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC74BQ96LY2 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC74BQ96LY2 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC74BQ96LY2 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC74BQ96LY2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC74BQ96LY2 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC74BQ96LY2 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC74BQ96LY2 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC74BQ96LY2 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC74BQ96LY2 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC74BQ96LY2 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC74BQ96LY2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC74BQ96LY2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC74BQ96LY2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC74BQ96LY2 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC74BQ96LY2 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC74BQ96LY2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC74BQ96LY2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC74BQ96LY2 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC74BQ96LY2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC74BQ96LY2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC74BQ96LY2 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC74BQ96LY2 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC74BQ96LY2 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC74BQ96LY2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC74BQ96LY2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC74BQ96LY2 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC74BQ96LY2 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC74BQ96LY2 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC74BQ96LY2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC74BQ96LY2 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC74BQ96LY2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC74BQ96LY2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC74BQ96LY2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC74BQ96LY2 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC74BQ96LY2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC74BQ96LY2 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC74BQ96LY2 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC74BQ96LY2 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC74BQ96LY2 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC74BQ96LY2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC74BQ96LY2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC74BQ96LY2 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC74BQ96LY2 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC74BQ96LY2 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC74BQ96LY2 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC74BQ96LY2 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC74BQ96LY2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC74BQ96LY2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC74BQ96LY2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC74BQ96LY2 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC74BQ96LY2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC74BQ96LY2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC74BQ96LY2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC74BQ96LY2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC74BQ96LY2 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC74BQ96LY2 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC74BQ96LY2 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC74BQ96LY2 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC74BQ96LY2 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC74BQ96LY2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC74BQ96LY2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC74BQ96LY2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC74BQ96LY2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC74BQ96LY2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC74BQ96LY2 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC74BQ96LY2 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC74BQ96LY2 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC74BQ96LY2 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC74BQ96LY2 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC74BQ96LY2 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC74BQ96LY2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC74BQ96LY2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC74BQ96LY2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC74BQ96LY2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC74BQ96LY2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC74BQ96LY2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC74BQ96LY2 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC74BQ96LY2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC74BQ96LY2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC74BQ96LY2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC74BQ96LY2 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC74BQ96LY2 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC74BQ96LY2 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms