Protein–RNA interactions for Protein: Q96LX7

CCDC17, Coiled-coil domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC17Q96LX7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC17Q96LX7 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC17Q96LX7 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC17Q96LX7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC17Q96LX7 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC17Q96LX7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC17Q96LX7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC17Q96LX7 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC17Q96LX7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC17Q96LX7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC17Q96LX7 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC17Q96LX7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC17Q96LX7 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC17Q96LX7 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC17Q96LX7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC17Q96LX7 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC17Q96LX7 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC17Q96LX7 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC17Q96LX7 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC17Q96LX7 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC17Q96LX7 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC17Q96LX7 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC17Q96LX7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC17Q96LX7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC17Q96LX7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC17Q96LX7 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC17Q96LX7 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC17Q96LX7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC17Q96LX7 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC17Q96LX7 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC17Q96LX7 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC17Q96LX7 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC17Q96LX7 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC17Q96LX7 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC17Q96LX7 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC17Q96LX7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC17Q96LX7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC17Q96LX7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC17Q96LX7 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC17Q96LX7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC17Q96LX7 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC17Q96LX7 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC17Q96LX7 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
CCDC17Q96LX7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC17Q96LX7 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC17Q96LX7 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC17Q96LX7 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC17Q96LX7 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC17Q96LX7 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC17Q96LX7 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC17Q96LX7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC17Q96LX7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC17Q96LX7 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC17Q96LX7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC17Q96LX7 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC17Q96LX7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC17Q96LX7 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC17Q96LX7 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC17Q96LX7 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC17Q96LX7 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC17Q96LX7 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC17Q96LX7 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC17Q96LX7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC17Q96LX7 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC17Q96LX7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC17Q96LX7 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC17Q96LX7 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC17Q96LX7 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC17Q96LX7 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC17Q96LX7 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC17Q96LX7 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC17Q96LX7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC17Q96LX7 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC17Q96LX7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC17Q96LX7 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC17Q96LX7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC17Q96LX7 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC17Q96LX7 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC17Q96LX7 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC17Q96LX7 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC17Q96LX7 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC17Q96LX7 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC17Q96LX7 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC17Q96LX7 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC17Q96LX7 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC17Q96LX7 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC17Q96LX7 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC17Q96LX7 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC17Q96LX7 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC17Q96LX7 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC17Q96LX7 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC17Q96LX7 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC17Q96LX7 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC17Q96LX7 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC17Q96LX7 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC17Q96LX7 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC17Q96LX7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC17Q96LX7 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC17Q96LX7 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC17Q96LX7 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms