Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT7

C9orf72, Guanine nucleotide exchange C9orf72, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf72Q96LT7 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C9orf72Q96LT7 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C9orf72Q96LT7 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C9orf72Q96LT7 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C9orf72Q96LT7 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
C9orf72Q96LT7 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C9orf72Q96LT7 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C9orf72Q96LT7 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C9orf72Q96LT7 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C9orf72Q96LT7 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C9orf72Q96LT7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C9orf72Q96LT7 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C9orf72Q96LT7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C9orf72Q96LT7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C9orf72Q96LT7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C9orf72Q96LT7 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C9orf72Q96LT7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
C9orf72Q96LT7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C9orf72Q96LT7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C9orf72Q96LT7 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C9orf72Q96LT7 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C9orf72Q96LT7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C9orf72Q96LT7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C9orf72Q96LT7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C9orf72Q96LT7 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C9orf72Q96LT7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C9orf72Q96LT7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C9orf72Q96LT7 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C9orf72Q96LT7 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C9orf72Q96LT7 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C9orf72Q96LT7 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C9orf72Q96LT7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C9orf72Q96LT7 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C9orf72Q96LT7 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C9orf72Q96LT7 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C9orf72Q96LT7 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C9orf72Q96LT7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C9orf72Q96LT7 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C9orf72Q96LT7 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C9orf72Q96LT7 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C9orf72Q96LT7 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C9orf72Q96LT7 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C9orf72Q96LT7 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C9orf72Q96LT7 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C9orf72Q96LT7 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C9orf72Q96LT7 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C9orf72Q96LT7 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
C9orf72Q96LT7 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C9orf72Q96LT7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C9orf72Q96LT7 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C9orf72Q96LT7 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
C9orf72Q96LT7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
C9orf72Q96LT7 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C9orf72Q96LT7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C9orf72Q96LT7 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C9orf72Q96LT7 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C9orf72Q96LT7 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C9orf72Q96LT7 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C9orf72Q96LT7 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C9orf72Q96LT7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C9orf72Q96LT7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C9orf72Q96LT7 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C9orf72Q96LT7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C9orf72Q96LT7 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C9orf72Q96LT7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C9orf72Q96LT7 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C9orf72Q96LT7 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C9orf72Q96LT7 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C9orf72Q96LT7 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C9orf72Q96LT7 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C9orf72Q96LT7 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C9orf72Q96LT7 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
C9orf72Q96LT7 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C9orf72Q96LT7 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C9orf72Q96LT7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C9orf72Q96LT7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C9orf72Q96LT7 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
C9orf72Q96LT7 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C9orf72Q96LT7 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C9orf72Q96LT7 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C9orf72Q96LT7 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C9orf72Q96LT7 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C9orf72Q96LT7 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C9orf72Q96LT7 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C9orf72Q96LT7 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C9orf72Q96LT7 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C9orf72Q96LT7 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C9orf72Q96LT7 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
C9orf72Q96LT7 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C9orf72Q96LT7 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C9orf72Q96LT7 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C9orf72Q96LT7 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C9orf72Q96LT7 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C9orf72Q96LT7 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C9orf72Q96LT7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C9orf72Q96LT7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C9orf72Q96LT7 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C9orf72Q96LT7 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C9orf72Q96LT7 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C9orf72Q96LT7 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms